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青花菜BoBURP1基因的克隆与表达分析

2016-11-21章燕如俞可可周秀倩蒋晓颖

浙江农业学报 2016年9期
关键词:植物

章燕如,俞可可,龚 秀,周秀倩,祝 琦,许 鑫,朱 欣,吕 奕,蒋晓颖,蒋 明

(台州学院生命科学学院,浙江椒江318000)

青花菜BoBURP1基因的克隆与表达分析

章燕如,俞可可,龚 秀,周秀倩,祝 琦,许 鑫,朱 欣,吕 奕,蒋晓颖,蒋 明∗

(台州学院生命科学学院,浙江椒江318000)

BURP是一类存在于植物中的特有蛋白,在生长发育和逆境响应等方面起重要作用。试验从青花菜中克隆到一个BURP基因,命名为BoBURP1,在生物信息学分析的基础上,用RT-PCR研究了它在不同器官中的表达模式。研究结果表明,BoBURP1的基因组DNA全长2 030 bp,具2个内含子;编码区全长为1 872 bp,编码623个氨基酸;推导的蛋白质分子量为70.795 6 ku,等电点为8.65。系统发育分析结果表明,BoBURP1与12种不同植物的同源蛋白可分为3组,BoBURP1与十字花科植物同源序列的相似性最高,在进化树上聚为一组。RT-PCR结果表明,BoBURP1在根、茎、叶、花蕾、花和角果中均有表达,叶、花蕾和花的表达量最高,而根和茎中的表达量最低。

青花菜;BURP;克隆;表达

BURP是一类植物特有蛋白,在生长发育、物质代谢和逆境胁迫响应过程中起重要作用[1]。BURP最早由Hattori等[2]在研究油菜(Brassica napus)胚胎发生过程中,根据BNM2蛋白的序列特征定义。BURP家族的命名来源于油菜BNM2(microspore-derived embryo 2)、蚕豆(Vicia faba)USPs(unknown seed proteins)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)RD22(responsive to dehydration 22)和番茄(Lycopersicon esculentum)PG1β(beta subunit of polygalacturonase isoenzyme 1)这4种蛋白名称的首字母,它们的共同特征是含有相似的结构域,即N端具疏水的信号肽序列,C端含保守的BURP结构域,中间有一段保守序列或重复序列[3-5]。其中的 PG1β是多聚半乳糖醛酸酶1(polygalacturonase 1,PG1)的一个亚基,它参与果胶物质的代谢,在番茄中,PG1β基因的表达具有果实特异性[6-7]。PG又称果胶酶(pectic enzyme),是一种细胞壁结构蛋白,能催化果胶分子α-(1,4)-多聚半乳糖醛酸的裂解,使细胞壁结构解体[8]。……

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