王铁霖，李晶，杨玉文，赵廷昌

中国农业科学院植物保护研究所，植物病虫害生物学国家重点实验室，北京 100193

烟草野火病菌Pseudomonas syringaepv.tabaciyuexi-1信号肽预测及分析

王铁霖，李晶，杨玉文，赵廷昌

中国农业科学院植物保护研究所，植物病虫害生物学国家重点实验室，北京 100193

利用SignalP 4.0、 LipoP 1.0 及TMHMM v2.0对烟草野火病菌Pseudomonas syringaepv.tabaciyuexi-1菌株基因组中信号肽的数量、长度和氨基酸组成进行了预测及分类。结果确定其中432个ORFs (Open reading frame) 所编码的N 端有信号肽序列，占全部ORFs的8.81%。其中351条分泌型信号肽 (SPI)，81条脂蛋白型信号肽 (SPII)。在分泌型信号肽中，信号肽的长度为11～42个氨基酸，以长度为22个氨基酸的信号肽最多。同源性分析结果显示，具有相同信号肽序列的不同蛋白序列之间是高度保守的。该研究提供了野火病原菌致病因子的备选基因，提高该病菌致病因子的筛选效率。

Pseudomonas syringaepv.tabaci；信号肽；SignalP 4.0；LipoP 1. 0；TMHMM v2.0

烟草野火病是烟草生产上一种重要的叶部细菌性病害。该病害在苗期、大田期均可发生，主要危害烟草叶片，也可危害幼茎、蒴果、萼片等器官，给烟草种植业造成了巨大的经济损失[1-2]。大部分病原菌的毒素、细胞壁降解酶等致病因子为分泌蛋白。而信号肽在分泌蛋白跨膜、 转运及识别植物受体蛋白过程中起着非常重要的作用[3-4]。

信号肽一般由10～40个氨基酸残基组成，通常大致分为3个区段：其中N端为碱性氨基末端，通常由带正电荷的氨基酸组成；中间为疏水中心，主要由20个或以上的中性氨基酸组成；C端为加工区，含有被信号肽酶裂解的部位，其中小分子氨基酸如甘氨酸、丙氨酸、丝氨酸较多[5,6]。……