高翔，李栋梁，赵景义，徐发荣，陈艳红，周磊

（1.中国农业大学动物医学院，北京海淀100193；2.北京市动物疫病预防控制中心，北京大兴102600）

猪流行性腹泻病毒SD2014株全基因组序列测定与遗传演化分析

高翔1，李栋梁2，赵景义2，徐发荣2，陈艳红1，周磊1

（1.中国农业大学动物医学院，北京海淀100193；2.北京市动物疫病预防控制中心，北京大兴102600）

为分析猪流行性腹泻病毒（PEDV）在国内的流行及变异情况，对2014年在山东省某猪场流行的PEDV毒株SD2014进行全基因组测序，并与国内外代表毒株进行序列比对、同源性分析和遗传演化分析。结果表明，SD2014毒株全长28，036 nt（除去PolyA）。遗传演化分析显示该毒株与美国分离株OH851以及我国2010年后分离的变异毒株属于同一分支。通过对S基因和ORF3序列进行对比，发现SD2014与我国早期分离株BJ-2011-1变异位点相似，且与欧美毒株和疫苗株（CV777）差异明显。提示自2010年PED暴发后，与疫苗株差异较大的变异株仍在国内流行，该病防控形势依然严峻。

猪流行性腹泻病毒；全基因组序列；遗传演化

猪流行性腹泻（Porcine epidemic diarrhea，PED）由猪流行性腹泻病毒（Porcine epidemic diarrhea virus，PEDV）引起的一种猪的高度接触性传染病，感染猪以急性肠炎、水样腹泻、呕吐为主要特征［1-2］。5日龄及以下仔猪由于腹泻和呕吐造成严重脱水，死亡率可高达90%～100%。该病自1971年首次在英国被发现以来［3］，在世界上多个养猪国家均已有报道［4-7］。2010年冬季以来，我国各省份均暴发了有史以来最为严重的PED，2013年5月后北美各国及日本也有大量关于PED的报道［8-13］。对大量PEDV临床分离株进行序列测定及抗原分析发现，不同的PEDV毒株在基因序列和抗原性等方面都存在较大差异，并可导致致病性的差异。……