阮桢媛 王兵益 欧阳志勤 廖礼彬 苏腾伟 乔 璐

(1.云南林业职业技术学院，昆明 650224； 2.中国林业科学研究院资源昆虫研究所，昆明 650224； 3.云南省环境科学研究院， 昆明 650034)

极度濒危植物巧家五针松基因组微卫星特征分析

阮桢媛1王兵益2*欧阳志勤3廖礼彬2苏腾伟1乔 璐1

(1.云南林业职业技术学院，昆明 650224；2.中国林业科学研究院资源昆虫研究所，昆明 650224；3.云南省环境科学研究院， 昆明 650034)

巧家五针松是世界极度濒危植物，对其SSR引物的开发有助于其遗传学研究以及物种的保护。本研究通过Illumina高通量测序技术获得巧家五针松全基因组序列，并以MISA软件查找得到2 651个微卫星序列，其中单核苷酸重复最多，可能预示了其悠久的进化历史。不同重复类型中，A/T含量显著高于G/C；在不同长度重复单元中，二核苷酸重复微卫星长度变异程度最高；各重复类型微卫星长度与微卫星出现的频率成反比。获得的微卫星序列能够满足巧家五针松的种群遗传学研究，而且反映了该物种的偏好性及对应的潜在功能，并且对该物种的保护提供了资料。

巧家五针松；基因组；微卫星

巧家五针松(PinussquamataX.W.Li)是李乡旺于上世纪90年代发现的仅分布于我国云南省巧家县的珍稀树种[1]，天然状态下该种仅存立木31株，其野外种群低于稳定存活界限(野生株数≤5 000株)，随时有灭绝的危险，2008年被列入云南省极小种群物种，2010年云南省林业厅、云南省绿色环境发展基金会指导资助开展对其实施野外救护项目，且被列入全球100种最濒危物种名录[2]。……