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白桦BpCesA基因的生物信息学及表达分析

2016-11-10申婷婷刘桂丰许思佳李慧玉袁红梅

植物研究 2016年6期
关键词:分析研究

申婷婷 姜 静 刘桂丰 许思佳 李慧玉* 袁红梅,2

(1.东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室,哈尔滨 150040; 2.黑龙江省农业科学院经济作物研究所,哈尔滨 150086)

白桦BpCesA基因的生物信息学及表达分析

申婷婷1姜 静1刘桂丰1许思佳1李慧玉1*袁红梅1,2

(1.东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室,哈尔滨 150040;2.黑龙江省农业科学院经济作物研究所,哈尔滨 150086)

从白桦45个转录组数据中分析获得6条白桦纤维素合成酶基因,其中2条为该家族的新基因,通过生物信息学及实时定量PCR技术探讨白桦BpCesA在不同材性白桦中的表达量情况。结果表明,6条白桦BpCesA基因的ORF长度在2 958~3 312 bp,编码的氨基酸数目在985~1 103 aa,相对分子量在110.40~124.29 kD,理论等电点为5.90~7.43;6条BpCesA均含有D,D,D,QXXRW保守结构域和8个跨膜螺旋,其中2个位于N端,6个位于C端。对来自6个双子叶植物,4个单子叶植物和1个裸子植物的52条CesA进行了聚类分析发现:白桦BpCesA与同为木本的杨树PtrCesA具有较高的同源性,其中BpCesA2与PtrCesA3同源性达到92%、另外BpCesA5与PtrCesA6、BpCesA1与PtrCesA8也具有较高的同源性,分别为89%和82%。BpCesA1、BpCesA2、BpCesA3、BpCesA5基因随纤维素含量的增加,表达量也呈现增加趋势,推测这些基因在白桦的纤维素合成中起到促进的作用。本研究为揭示纤维素合成酶基因的功能分析提供了基础。

白桦;纤维素;木质素;生物信息学;表达量

白桦(BetulaplatyphyllaSuk.)属桦木科(Betulaceae)桦木属(Betula),广泛分布于我国东北、华北、西北、西南等14个省区。白桦形态优美,树皮光滑洁白,有较高的观赏价值,适合作为城市绿化树种[1]。20世纪90年代初白桦被列为国家科技攻关研究对象之一,目前白桦作为国家科技支撑计划研究的树种,我国已在其种源分析[2]、木材形成[3]、花发育调控[4]以及扦插繁殖等方面进行了大量的研究工作,而日益成熟的生物技术也为这些研究提供了全新的思路。……

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