SgP5CS基因克隆和生物信息学分析
2016-11-01金杭霞董德坤杨清华朱丹华
金杭霞,董德坤,王 伟,杨清华,朱丹华,*
(1.浙江省农业科学院 作物与核技术利用研究所,浙江 杭州 310021;2.萧山区种子管理站,浙江 杭州 311201)
SgP5CS基因克隆和生物信息学分析
金杭霞1,董德坤1,王伟2,杨清华1,朱丹华1,*
(1.浙江省农业科学院 作物与核技术利用研究所,浙江 杭州 310021;2.萧山区种子管理站,浙江 杭州 311201)
利用同源克隆的方法,获得了碱蓬P5CS基因全长ORF,命名为SgP5CS。SgP5CS ORF全长2 151 bp,生物信息学软件预测其编码716个氨基酸组成的多肽,相对分子量为77 431.8 u,等电点为5.71,为稳定的亲水性蛋白,无跨膜结构域。ClustalX多重序列比对发现SgP5CS编码的氨基酸序列与盐角草P5CS相似性为93%,与盐角草P5CS的亲缘关系最近,其次是甜菜。脯氨酸是生物体内重要的渗透调节剂,而Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶则是植物合成脯氨酸的关键酶之一,SgP5CS的克隆将为进一步的功能分析鉴定基础。
碱蓬;P5CS;脯氨酸
脯氨酸在植物体内起重要作用,不仅作为一种氨基酸构成了蛋白结构,还能以渗透调节剂身份起到维持细胞内水分、稳定亚细胞结构等作用。在植物体中,目前已知的脯氨酸合成途径有谷氨酸和鸟氨酸两条途径,而在植物遭受逆境环境时,谷氨酸途径是脯氨酸合成的主要途径[1-2]。Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(P5CS,EC 2.7.2.11/ 1.2.1.41)是谷氨酸合成途径中的限速酶,当植物受到胁迫诱导时,P5CS的反馈调节在控制植物脯氨酸的水平中起着重要作用[3-4]。目前已从烟草[5]、羊草[6]、桑树[7]、苜蓿[8]、苎麻[9]、高粱[10]等多种植物中克隆到编码该酶的基因,并且在拟南芥[11]、苜蓿[12]、小麦[13]、烟草[5]等植物中发现,过量表达P5CS基因能提高转基因植物体内脯氨酸含量,进而提高植物抗旱耐盐性能。……
