人类白细胞抗原基因HLA—B58∶01基因型的快速低成本鉴别方法
2016-10-21初亚男张婕妤封利颖周国华
初亚男 张婕妤 封利颖 周国华



摘要:采用焦磷酸测序技术和改进的全血基因组提取方法,建立了位于6号染色体的银屑病易感基因1候选基因1(Psoriasis susceptibility 1 candidate 1,PSORS1C1)rs9263726位点的焦磷酸测序方法,检出限达到0.4 ng/μL基因组DNA,20例标本的焦磷酸法和Sanger法测序结果完全一致。利用本方法对683例标本的rs9263726位点进行测序,得到中国人群该位点野生型(GG型)分布频率为87.6%,突变的GA型分布频率为11.7%、AA型分布频率为0.7%。通过对随机选取的46例标本rs9263726位点与人类白细胞抗原基因HLAB*58∶01基因型的连锁关系进行分析,结果表明,该位点预测HLAB*58∶01基因型的灵敏度为100%、特异性为91.3%。本方法可用于HLAB*58∶01基因型的检测。
关键词 :人类白细胞抗原基因HLAB*58∶01; 焦磷酸测序; rs9263726位点; 基因型
1 引 言
别嘌呤醇被广泛应用于临床高尿酸血症的常规治疗,但是其皮肤型不良反应在用药前无法预知,特别需要注意的是,发生不良反应的人群中约有1%~5%为StevensJohnson综合征(SJS,皮肤脱落小于体表面积的10%,死亡率为1%~5%),20%~30%为中毒性表皮坏死松解征(TEN,皮肤脱落大于体表面积30%, 死亡率25%~35%)[1,2],急剧增加了患者的死亡风险。2005年, Hung等[3]发现,由于别嘌呤醇引发SJS/TEN的51位中国汉族人,全部含有人白细胞抗原基因HLAB*58∶01;2009年,Tassaneeyakul等对泰国人别嘌呤醇致敏的分析发现,HLAB*58∶01等位基因预测别嘌呤醇诱发的SJS/TEN过敏的灵敏度(含有HLAB*58∶01等位基因的标本正确判定此标本会发生别嘌呤醇誘发的SJS/TEN过敏反应的比例)为100%,特异性(不含有HLAB*58∶01等位基因的标本正确判定此标本不会发生别嘌呤醇诱发的SJS/TEN过敏反应的比例)为87%[4]。据最新dbMHC等位基因频率数据库统计,HLAB*58∶01等位基因的携带频率欧洲为0.77%,北美洲为0.38%,大洋洲为2.5%,东北亚为6.1%,在世界不同地区人群中的携带频率有显著的差异。……
