猪ifitm基因克隆及其序列和组织表达分析
2016-09-26张玉娟李超燕郑文明
张玉娟,赵 婷,徐 朝,于 琨,马 倩,李超燕,郑文明,许 君
(河南农业大学生命科学学院,河南 郑州 450002)
猪ifitm基因克隆及其序列和组织表达分析
张玉娟,赵 婷,徐 朝,于 琨,马 倩,李超燕,郑文明,许 君
(河南农业大学生命科学学院,河南 郑州 450002)
为了研究ifitm基因的功能,本研究从猪肾PK15细胞中克隆了猪的3个ifitmcDNA序列,分析了猪ifitm1、ifitm2和ifitm3基因的染色体定位及其与其他物种基因序列的同源关系,并对不同ifitm在不同组织的表达进行分析和检测。结果显示,猪ifitm和人、鼠ifitm具有相同的基因和蛋白结构,进化上与牛ifitm高度同源,ifitm1和ifitm3在脾、肾、心、肝等组织中大量表达,而ifitm2只在脾和肾中检测到表达,在其他组织中的表达量相对较小。猪ifitm基因的克隆、生物信息学及组织表达分析为进一步研究其在猪细胞中的功能奠定了基础。
干扰素刺激基因;猪干扰素诱导的跨膜蛋白;基因克隆;基因序列;组织表达差异
干扰素(interferon,IFN) 是一种由单核细胞和淋巴细胞产生的细胞因子,具有抗病毒、影响细胞生长、调节免疫功能等多种生物活性。IFN抗病毒生物学功能的发挥主要依赖于干扰素信号通路激活后众多下游干扰素刺激基因(interferon stimulate gene,ISG)的表达。干扰素诱导的跨膜蛋白 (interferon induced transmembrane protein,ifitm)是ISG中最引人注目的家族之一[1-3],受干扰素刺激后可大量表达,在调控细胞增殖、抵抗病原感染等一系列细胞生物学活动中发挥着重要作用。目前,ifitm在进化上比较保守,已在许多物种中被发现[4]。人类基因组中,有5个ifitm基因,其中对ifitm1、ifitm2、ifitm3和ifitm5的功能性研究较多,对ifitm10的研究鲜见报道[5]。……
