巴马香猪周身皮肤厚度的测量及其与7号染色体候选SNPs位点的关联分析
2016-09-09黄晓畅邱恒清严国荣黄贻忠张弋峰江嘉程周李生麻骏武肖石军黄路生艾华水
中国农业科学 2016年16期
关键词:关联
黄 涛,黄晓畅,邱恒清,严国荣,黄贻忠,张弋峰,江嘉程,周李生,任 军,麻骏武,肖石军,黄路生,杨 斌,艾华水
(江西农业大学省部共建猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室,南昌 330045)
巴马香猪周身皮肤厚度的测量及其与7号染色体候选SNPs位点的关联分析
黄 涛,黄晓畅,邱恒清,严国荣,黄贻忠,张弋峰,江嘉程,周李生,任 军,麻骏武,肖石军,黄路生,杨 斌,艾华水
(江西农业大学省部共建猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室,南昌 330045)
【目的】 测定中国地方小型猪品种巴马香猪成年时周身9个典型部位的皮肤厚度,揭示巴马香猪不同部位皮肤厚度变化规律;进行9个部位皮肤厚度与候选SNPs位点的关联分析,在巴马香猪群体中验证影响皮肤厚度的7号染色体主效QTL,为进一步在巴马香猪群体中大规模开展皮肤厚度等形态变化的分子遗传控制机理及其相关基因功能研究奠定基础,从而增强人们对猪皮肤的认知。【方法】从一个由319头300日龄巴马香猪组成的成年屠宰群体中,随机选取50头,包括27头母猪和23头阉割公猪,分别取头脸、肩、背、肷、臀、胸、下腹、腋下和管等9个部位的皮肤,利用电子游标卡尺对这些不同部位皮肤厚度进行精确测量,利用R语言基本统计包进行不同部位和不同性别间皮肤厚度的差异分析以及不同部位间皮肤厚度的相关分析。在猪7号染色体34.5—36.2 Mb的区域选取46个SNPs位点,利用MassARRAY时间飞行质谱技术进行基因分型,结合上述测定的皮厚表型,利用广义混合线性模型及 R 语言SNPassoc软件包进行目标候选区域的关联分析。……
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