徐 莹，晏国全，张 扬，余红秀

（复旦大学生物医学研究院，上海 200032）

中国3个主栽烟草品种的差异蛋白质组学研究

徐 莹，晏国全，张 扬，余红秀

（复旦大学生物医学研究院，上海 200032）

【目的】从全蛋白质组学水平研究烟草，筛选具有重要特性的蛋白质，阐明其相关代谢通路，使得烟草的基础科学研究和品种培育工作有所突破。【方法】利用苯酚法提取中国 3个主栽烟草品种红花大金元、K326和云烟87叶片的蛋白质，酶解后采用串联质量标签技术（tandem mass tag，TMT）标记，结合二维液相色谱串联质谱技术（2D LC-MS/MS）对3个烟草品种叶片的蛋白质组成进行分析，运用Proteome Discoverer软件提取谱图后在 MASCOT 搜索引擎上鉴定蛋白质和肽段，并对鉴定的蛋白质进行系统的生物信息学分析，包括数据相关性分析、分层聚类分析和主成分分析，同时按照2倍上下调的原则采用火山图筛选不同品种烟草中表达差异显著的蛋白质，最后利用 KEGG通路分析烟草中重要蛋白质的分布及功能。【结果】鉴定红花大金元、K326和云烟 87烟草样品的蛋白质Group总数为3 079，蛋白质ID数为10 343。从分层聚类分析和主成分分析中蛋白质的整体表达情况可见，K326和云烟87蛋白质表达情况较相似，而红花大金元与前两者相差较大。后续的差异蛋白质筛选也验证了该结果，表现为云烟87和K326之间仅存在29个差异表达的蛋白质，其中13个蛋白质覆盖8条代谢通路，包括类黄酮生物合成，参与类黄酮合成路径的查尔酮合成酶在K326中的相对含量显著高于云烟87。红花大金元和云烟……