蔡开聪　郑　轩　刘亚男　留珊红　杜芬芬

(1福建师范大学化学与化工学院，福州350007；2福建省理论与计算化学重点实验室，福建厦门361005)

甘氨酸二肽分子酰胺-I带光谱与结构相关性

蔡开聪1,2,*郑轩1,2刘亚男1,2留珊红1,2杜芬芬1,2

(1福建师范大学化学与化工学院，福州350007；2福建省理论与计算化学重点实验室，福建厦门361005)

系统探索了蛋白质二肽模型分子——甘氨酸二肽(GLYD)在气相与水溶液中的结构与光谱特性。从分子动力学轨迹中提取具有代表性结构的GLYD-D2O聚集体的瞬态结构开展简正模式分析，获取了对蛋白质二级结构敏感的酰胺-I带的振动光谱参数，建立起振动光谱与特征基团结构间的相关性。将溶剂作用以静电势场的形式投影至二肽分子骨架中，与酰胺-I带在气/液相中的频率差相关联，并引入酰胺-I带简正模式随二级结构变化的规律，将各个构象态可能存在的振动耦合包含在内，构建具有二级结构敏感性的静电频率转换图，实现溶液相中多肽骨架酰胺-I带的快速准确预测。

甘氨酸二肽；酰胺-I带；振动光谱；静电频率图

蛋白质及多肽的骨架上酰胺-I带(主要为C＝O的伸缩振动)在中红外区域具有强烈的振动吸收，其特征吸收峰对分子骨架二级结构的变化十分敏感，因此广泛用作蛋白质及多肽的结构探针5。酰胺-I带的特征振动吸收谱带位于1600－1700 cm－1，对于特定的二级结构可以用“指纹”识别的方法进行鉴定：如α螺旋在1655 cm－1处有一个特征吸收峰，且随着螺旋链的增长而红移；而β折叠则出现明显的双峰，其在1630 cm－1处有个较强吸收峰，在1685 cm－1处吸收峰相对较弱6－9。……