黄娟,任颖超,张玉凤,单虎

(青岛农业大学山东省高校预防兽医学重点实验室,山东青岛266109)

猪繁殖与呼吸综合征病毒新结构蛋白基因ORF5a分子特征

黄娟,任颖超,张玉凤,单虎

(青岛农业大学山东省高校预防兽医学重点实验室,山东青岛266109)

本研究采用RT-PCR方法从临床病料中扩增得到了5株猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)山东流行株新结构蛋白ORF5a基因序列,并与国内外其他22株PRRSV ORF5a基因序列进行了比较和分析.结果表明,5株PRRSV山东株ORF5a基因CDS为141 bp,编码46个氨基酸,序列同源性为93.6%～100%(nt)和89.4%～100%(aa);5株山东株与其他Ⅱ型PRRSV同源性为83.0%～99.3%(nt)和72.3%～100%(aa).在ORF5a蛋白上高度保守的R/Q基序区,LX13 (3)株有3个氨基酸的变异,CY13株有1个氨基酸的变异.与2006年以前的毒株相比,我国2006年以后分离的毒株第8、12、28位和42位的氨基酸发生了变异.进化树分析表明,5株PRRSV山东株与高致病性PRRSV代表株JXA1株在同一个亚群.

猪繁殖与呼吸综合征病毒;结构蛋白;ORF5a基因;序列分析

猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)于1987年首次发现,我国1996年首次分离到其病原PRRSV, 2006年出现高致病性PRRSV变异株[1].目前该病尚无有效治疗药物,免疫接种也不能完全保护[2].目前,PRRSV的毒力、致病机理及保护性免疫的机制都还缺乏详细的阐述,制约了新型疫苗的研制及PRRS的有效防控.

PRRSV为动脉炎病毒属成员,根据基因和抗原差异性可分为欧洲型(Ⅰ型,代表株LV)和美洲型(Ⅱ型,代表株VR-2332).2011年在动脉炎病毒中发现存在嵌合基因ORF5a,该基因起始于ORF5上游第10 nt处,编码43 aa～64 aa,其中,PRRSV ORF5a蛋白氨基酸序列欧洲型(Ⅰ型)为43 aa,美洲型(Ⅱ型)为46 aa或51 aa[3].ORF5a基因和GP5蛋白基因部分重叠……