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利用TCGA数据集分析AKT3在胃癌中的表达及临床意义

2016-09-05郑春雷曲秀娟曲晶磊车晓芳刘云鹏

中国医科大学学报 2016年5期
关键词:胃癌利用分析

王 硕,李 智,郑春雷,曲秀娟,刘 静,曲晶磊,车晓芳,刘云鹏

(中国医科大学附属第一医院肿瘤内科,沈阳110001)

利用TCGA数据集分析AKT3在胃癌中的表达及临床意义

王硕,李智,郑春雷,曲秀娟,刘静,曲晶磊,车晓芳,刘云鹏

(中国医科大学附属第一医院肿瘤内科,沈阳110001)

目的研究AKT3在胃癌中的表达情况,预测并探讨AKT3参与肿瘤发生发展的可能机制及临床价值。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库收集胃癌数据集,下载AKT3基因表达谱资料及临床信息资料。分析AKT3表达与胃癌临床病理学参数的相关性及对预后的影响。采用基因集富集分析(GSEA)方法预测AKT3的调控基因。结果AKT3表达水平与肿瘤浸润深度(P=0.001)、TNM分期(P=0.049)、分化程度(P<0.001)相关,肿瘤恶性程度越高,AKT3表达越高。AKT3高表达患者总生存期明显短于低表达患者(P<0.001)。AKT3高表达样本富集了细胞黏附、骨架蛋白调控、紧密连接、TGF-β通路等基因集。结论在胃癌中,AKT3高表达是一种预后不良因素,可以作为预测患者转移发生、判断预后的有效生物标志物。

胃癌;癌症基因组图谱;AKT3;预后

网络出版地址

胃癌是我国最常见的恶性肿瘤之一,虽然手术联合放、化疗及靶向治疗的应用使患者的生存期延长,但晚期患者的5年生存率仍很低。其关键因素是转移机制不明,且无有效的标志物预测转移发生。因此从分子水平深入探讨胃癌的转移机制对延长晚期患者生存时间至关重要。

AKT是一种丝/苏氨酸蛋白激酶,通过依赖PI3K的机制参与肿瘤发生发展的多个过程。AKT有3种亚型:AKT1、AKT2和AKT3[1-3]。3种亚型发挥不同的作用,目前对AKT3的研究相对较少,且主要集中于乳腺癌[4-6]、卵巢癌[7]、恶性胶质瘤[8]等,AKT3在胃癌中的表达及作用鲜有报道。……

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