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麻竹DlSCL6基因amiRNA前体合成及表达载体构建

2016-08-09陈东亮孙化雨李利超赵韩生高志民1北京市农林科学研究院北京农业生物技术研究中心北京100097国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点实验室北京10010

世界竹藤通讯 2016年2期
关键词:利用植物设计

陈东亮孙化雨李利超赵韩生高志民(1北京市农林科学研究院北京农业生物技术研究中心北京100097 国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点实验室北京10010)



麻竹DlSCL6基因amiRNA前体合成及表达载体构建

陈东亮1,2孙化雨2李利超2赵韩生2高志民2
(1北京市农林科学研究院北京农业生物技术研究中心北京100097 2国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点实验室北京100102)

Web MicroRNA Designer(WMD3)是一个专门应用于植物人工miRNA设计和前体序列设计的专业网站,其中利用重叠PCR法合成amiRNA前体序列,涉及多个PCR和纯化回收过程,步骤繁琐,周期较长。本研究利用WMD3设计了麻竹转录因子DlSCL6基因的人工miRNA序列和其前体序列,采用改进的重叠PCR方法,快速克隆获得了该前体序列,并以改造的pCMABIA1301载体为框架,构建了该前体的植物表达载体,为进一步研究利用amiRNA调控SCL6基因的表达奠定了基础。

麻竹;人工miRNA;重叠PCR;表达载体构建

microRNA(miRNA)是一类生物内源的小分子非编码RNA,广泛存在于动物、植物和微生物中。miRNA调控是基因表达转录后层面的重要调控方式之一,研究表明miRNA在植物的生长发育、物质代谢、信号转导以及抗逆等多种生理生化过程中发挥重要功能[1-3]。人工 miRNA (artificial miRNA,amiRNA)是通过模拟天然miRNA结构特点、作用机制,设计出一段与目标基因高度匹配的序列,利用分子生物学技术将其转入植物体内并使其表达,而达到对该基因抑制调控的目的。amiRNA的有效性已经在拟南芥 (Arabidopsis thaliana)、杨树 (Populus trichocarp)、水稻 (Oryza sativa)等十几种植物的数十个基因中得到验证[4-7]。

2009年,Weigel等发布了 WMD3软……

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