任付真，姚韩韩，董迎辉，周小龙，林志华*

(1. 上海海洋大学 水产与生命学院，上海 201306；2.浙江万里学院 生物与环境学院 浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室，浙江 宁波 315100)



泥蚶HDAC1基因cDNA全长、内含子克隆及时空表达特征分析

任付真1，2，姚韩韩2，董迎辉2，周小龙1，林志华2*

(1. 上海海洋大学 水产与生命学院，上海 201306；2.浙江万里学院 生物与环境学院 浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室，浙江 宁波 315100)

摘要：HDAC1作为HDACs家族中重要成员，可使组蛋白去乙酰化进而调节基因表达，在细胞分化和胚胎早期发育中起重要作用。本文利用SMART RACE技术克隆得到泥蚶HDAC1(Tg-HDAC1)基因的cDNA全长序列，并对其内含子进行扩增及不同组织、不同发育时期的定量表达。结果发现：Tg-HDAC1基因的cDNA序列全长为2 275 bp，开放阅读框(ORF)1 587 bp，编码528个氨基酸；Tg-HDAC1蛋白序列与斑马鱼、鸡、小鼠等的相似性都在80%以上，表明该蛋白氨基酸序列在物种进化过程中具有保守性；在Tg-HDAC1基因中扩增出13个内含子，均存在于开放阅读框中，且都遵循GT-AG原则；荧光定量PCR(qRT-PCR)分析结果显示，Tg-HDAC1基因在成体血液、内脏团、外套膜、鳃、斧足和闭壳肌6个组织中均有表达，而在足中的表达量最高，且与其余5组织中的表达量有极显著差异(P<0.01)，说明它对该组织生长具有重要作用。不同发育时期的表达差异结果表明，Tg-HDAC1基因在担轮幼虫期表达量最高，显著高于其他发育时期(P<0.05)。

关键词：泥蚶；组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)；基因克隆；内含子；表达分析

1引言

组蛋白去乙酰化酶1(Histone deacetylase 1， HDAC1)是HDACs家族中重要的一类蛋白酶，在几乎所有细胞的细胞核中均有表达，对细胞分化和胚胎发育起重要作用[1]。迄今HDAC1基因已在线虫(Caenorhabditiselegans)[2]、果蝇(Drosophilamelanogaster)[3]、斑马鱼(Daniorerio)[4]等模式生物中进行了大量研究。……