斑节对虾泛素融合蛋白UbL40基因的克隆及表达分析
2016-08-05傅明骏周发林邱丽华江世贵
傅明骏,吴 松,唐 蕾,周发林,邱丽华,江世贵
(1.中国水产科学研究院南海水产研究所/农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东 广州 510300;2.中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心,海南 三亚 572028;3.上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306;4.华南农业大学动物科学学院,广东 广州 510642)
斑节对虾泛素融合蛋白UbL40基因的克隆及表达分析
傅明骏1,2,吴 松1,3,唐 蕾1,4,周发林1,邱丽华1,江世贵1
(1.中国水产科学研究院南海水产研究所/农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东 广州 510300;2.中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心,海南 三亚 572028;3.上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306;4.华南农业大学动物科学学院,广东 广州 510642)
傅明骏,吴松,唐蕾,等.斑节对虾泛素融合蛋白UbL40基因的克隆及表达分析[J].广东农业科学,2016,43(4):144-150.
从斑节对虾(Penaeus monodon)肝胰腺转录组数据中筛选获得泛素融合蛋白UbL40基因(ubiquitin/ribosomal L40 fusion protein,PmUbL40)的部分序列,利用RACE技术克隆其cDNA全长序列,通过生物信息学进行结构分析;利用实时定量PCR技术检测该基因在斑节对虾不同组织及卵巢不同发育期的表达情况。结果表明,PmUbL40基因cDNA全长571 bp,开放阅读框(Open reading frame,ORF)长390 bp,编码129个氨基酸,预测分子量约14.7 ku,理论等电点为9.76。预测氨基酸序列的N-末端(1~76aa)为高度保守的泛素结构域,C-末端(77~129aa)为典型的核糖体蛋白L40结构域。多重序列比对表明不同物种的UbL40在进化过程中高度保守。实时定量PCR结果显示PmUbL40基因在肝胰腺的表达量最高,肌肉、卵巢次之,其他组织的表达较低;在卵巢发育过程中PmUbL40基因在II期表达最高,其次是V期,显著高于I、III、IV期。……
