千里光脂肪酸脱氢酶(D6D)的保守基序(CSM)与功能结构域分析
2016-07-25王蕾罗才林徐德林钱刚
王蕾++罗才林++徐德林+钱刚



摘要:Δ6-脂肪酸脱氢酶(Δ6 desaturase,D6D)是不饱和脂肪酸合成途径中的限速酶。以高等植物千里光为材料,通过构建全长cDNA文库克隆得到脂肪酸脱氢酶基因(D6D),明确了D6D基因的氨基酸保守基元序列(conserved sequence motif,CSM)对蛋白质功能结构域的决定作用。结果显示,千里光D6D基因由466个氨基酸残基组成;预测蛋白分子量为53.40 ku,理论等电点为8.48;进化树和序列比对结果提示3个富含His的保守基元序列(HisⅠ-片段、HisⅡ-片段、HisⅢ-片段)在不同物种中表现出高度保守性;三维结构预测结果表明,D6D基因的保守结构域以及一个类似于细胞色素(cytochrome,cyt)b5的血红素结合区是形成底物结合部位和酶催化活性中心的结构基础。
关键词:千里光;脂肪酸脱氢酶(D6D基因);保守基元序列(CSM);三维结构
中图分类号: S567.23+9.01文献标志码: A文章编号:1002-1302(2016)06-0073-05
收稿日期:2015-11-03
基金项目:国家自然科学基金(31560087);贵州省优秀科技教育人才省长基金(编号:黔省专合字2008-61号)。
作者简介:王蕾(1991—),女,黑龙江五大连池人,硕士研究生,主要从事药用植物分子遗传学研究。E-mail:1807840035@qq.com。
通信作者:钱刚,博士,教授,主要从事药用植物分子遗传学研究。E-mail:pengjiaqiong@163.com。脂肪酸脱氢酶是多不饱和脂肪酸合成途径中的关键酶,分为可溶性脱氢酶和膜结合脱氢酶,其中膜结合脱氢酶又可分为羧基定向的脂肪酸脱氢酶(“frond-end”脱氢酶)和甲基定向的脂肪酸脱氢酶[1]。脂肪酸脱氢酶结构上都有3个保守的组氨酸富集区,除此之外羧基定向的脱氢酶N端还有1个类似于细胞色素b5 Cytb5的血红素结合区(HPGG)[2-3]。
Δ6-脂肪酸脱氢酶(D6D)属于羧基定向的膜结合脱氢酶,它以NADH、细胞色素b5氧化还原酶和细胞色素b5作为电子供体催化甘油脂中的脂肪酸脱氢[4]。……
