主要作物中PAL基因家族的鉴定和序列分析
2016-07-25盖江涛沈建凯王鹏
盖江涛+++沈建凯++王鹏


摘要:苯丙氨酸解氨酶(PAL,phenylalanine ammonia-lyase [EC:4.3.1.24])存在于各种植物和部分微生物中,是与植物抗病性相关的关键酶,具有重要的植物生理意义。采用BLASTP的方法,依托全基因组数据库,获得了拟南芥[Arabidopsis thaliana (L.) Heynh.]、水稻(Oryza sativa L.)、玉米(Zea mays Linn.)、小麦(Triticum aestivum Linn.)、谷子[Setaria italica (L.) P. Beauv.]、大豆[Glycine max (Linn.) Merr.]6种植物中的PAL基因家族共45条序列,对其进行了系统进化分析、生物信息学分析等。分析结果显示:单子叶植物与双子叶植物分别聚集在不同的分支,说明单子叶植物水稻、玉米、小麦、谷子亲缘关系较近,双子叶植物拟南芥、大豆亲缘关系较近,而单子叶植物与双子叶植物亲缘关系较远,也说明PAL基因的分化在单子叶植物和双子叶植物分化前形成;酸性蛋白质占93.3%,稳定性蛋白占97.8%,有信号肽的蛋白占2.2%,有导肽的蛋白占4.4%,所有蛋白均为有明显跨膜现象的亲水性蛋白;所有PAL基因亚细胞定位于细胞质中,都有蛋白活性位点。分析结果为进一步研究作物中PAL代谢机理提供理论支持。
关键词:苯丙氨酸解氨酶;PAL;基因家族;氨基酸
中图分类号: Q78文献标志码: A
文章编号:1002-1302(2016)06-0045-05
苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL,EC:4.3.1.24)存在于各种植物和少数微生物中,是目前研究较多的与植物抗病性相关的酶,与植物抗毒素及酚类化合物的形成密切相关[1-2]。PAL不能直接抵御病虫害,但在植物体内通过苯丙烷类途径进一步转化为木质素、黄酮、异黄酮、生物碱等次生代谢产物来增强植株的抗性[3-4]。
1961年,Koukol等首次记录了高等植物中PAL酶的提取分离[5],此后关于这种酶的研究迅速展开,目前PAL已从水稻[6]、小麦[6]等多种植物中得到分离纯化,并对拟南芥[7]、水稻[8]等植物PAL基因进行了cDNA克隆和序列分析。……
