霍如雪 刘振宁 杨青 +王光全

摘要：多聚半乳糖醛酸酶（polygalacturonase，PG）属于一个大的水解酶家族，它通过降解果胶在植株生长发育过程中的细胞分离事件中发挥重要作用。为深入研究桃PG基因家族的功能，利用生物信息学方法对桃基因组中PG基因家族成员进行鉴定，对其基因和蛋白特征、保守结构域、基因进化树分类和基因表达模式等方面进行研究。结果表明，在桃基因组中共鉴定出了84个PG基因，可以聚类成7个分支A～G；PG基因在8条染色体上呈现不均匀分布，并存在明显的串联重复现象，共发现16个串联重复基因簇；利用 UniGene 数据库进行的组织表达分析。说明有 10 个基因在数据库中有表达数据，其中有6个基因具有组织表达特异性。

关键词：桃；多聚半乳糖醛酸酶；基因家族；生物信息学

中图分类号： S662.103文献标志码： A

文章编号：1002-1302（2016）06-0033-08

多聚半乳糖醛酸酶（polygalacturonase，PG）是一种细胞壁结合蛋白，具有水解酶性质，广泛存在于细菌、真菌和植物中。PG大约在52年以前被鉴定，并被证明参与到植株生长发育各个时期中果胶的降解。在降解果胶的诸多酶类中，PG属于其中最大的水解酶家族。目前，已经在拟南芥、水稻、杨树、白菜、黄瓜、甜瓜、卷柏、小立碗藓等物种中对其基因家族进行了鉴定，并在进化上进行了分析[1-8]。PG从性质上主要分成3种，即内切PG、外切PG、鼠李糖PG。根据不同的分类标准，不同研究者将PG聚类为不同的亚类。拟南芥A～F等6类中的PG基因在表达模式上存在差异，有些亚类的成员趋向于在营养组织中表达，而有些则趋向于在生殖器官中表达[8]。……