赵 芳，张同作，苏建平，慈海鑫，李生庆，李志宁，林恭华

(1.中国科学院西北高原生物研究所，青海 西宁 810001； 2.中国科学院大学，北京 100049；3.潍坊滨海开发区管委会，山东 潍坊 261108； 4.青海省畜牧兽医科学院，青海 西宁 810016)



青藏高原5种害鼠vkorc1基因的测序分析

赵 芳1,2，张同作1，苏建平1，慈海鑫3，李生庆4，李志宁4，林恭华1

(1.中国科学院西北高原生物研究所，青海 西宁 810001； 2.中国科学院大学，北京 100049；3.潍坊滨海开发区管委会，山东 潍坊 261108； 4.青海省畜牧兽医科学院，青海 西宁 810016)

摘要：维生素K环氧化物还原酶复合物1基因(vkorc1)的变异是导致鼠类对抗凝血杀鼠剂产生抗性的主要原因。本研究利用转录组测序的方法，分析青藏高原地区5种主要害鼠——高原鼢鼠(Eospalax baileyi)、高原鼠兔(Ochotona curzoniae)、长尾仓鼠(Cricetulus longicaudatus)、青海田鼠(Lasiopodomys fuscus)和喜马拉雅旱獭(Marmota himalayana)的vkorc1基因序列信息。同时，采集5个种群共54只高原鼢鼠，对vkorc1基因全序列进行测序分析。结果显示，从转录组组装结果中成功获得5种动物的vkorc1基因编码区全序列，其中青海田鼠、长尾仓鼠、高原鼢鼠vkorc1基因编码区长度为486 bp，喜马拉雅旱獭和高原鼠兔为492 bp；在DNA序列水平上，5种高原动物存在143个变异位点，与大鼠的序列相似性为80.1%～90.7%，而与小鼠的序列相似性为79.7%～89.8%。在氨基酸序列水平上，5种高原动物存在37个变异位点，大鼠的序列相似性为84.0%～92.0%，而与小鼠的序列相似性为85.9%～92.0%；未发现与已知抗凝血杀鼠剂抗性相关的氨基酸位点。对5个种群54只高原鼢鼠vkorc1基因全序列的测序分析显示，比对后的全长为1 808 bp，共检测到8个变异位点，其中两个为插入缺失位点，全部变异都发生在内含子区。……