小鼠冷冻胚胎和精子SNP遗传鉴定方法的建立
2016-07-15徐伟晁天柱刘丽均李凯肖君华
徐伟,晁天柱,刘丽均,李凯,肖君华*
(1.东华大学生物科学与技术研究所,上海 201620;2.上海斯莱克实验动物有限责任公司,上海 201615)
研究报告
小鼠冷冻胚胎和精子SNP遗传鉴定方法的建立
徐伟1,晁天柱1,刘丽均2,李凯1,肖君华1*
(1.东华大学生物科学与技术研究所,上海 201620;2.上海斯莱克实验动物有限责任公司,上海 201615)
【摘要】目的 建立小鼠冷冻胚胎和精子SNP(single nucleotide polymorphism)分型方法,用于冷冻胚胎和精子快速遗传鉴定方案。方法 以中科院上海实验动物中心(国家啮齿类实验动物种子中心上海分中心)提供的小鼠冷冻胚胎和精子为样本,采用全基因组扩增技术和PCR-LDR分型技术建立小鼠冷冻物SNP遗传鉴定方法。结果 全基因组扩增技术能大幅度增加冷冻胚胎样本的DNA总量;PCR-LDR分型方法适用于小鼠全基因组45个SNPs的分型;分型确定C57BL/6,BALB/c,FVB/NJ等胚胎和精子各10种近交系,SNP位点信息与测序结果一致;小鼠冷冻胚胎个数与SNPs检出个数成正比,当胚胎数达到12以上时SNP检出率100%。结论 实现近交系小鼠冷冻胚胎和精子快速SNP基因分型及遗传质量鉴定。
【关键词】小鼠;冷冻胚胎和精子;全基因组扩增;PCR-LDR分型;SNP遗传鉴定
模式动物小鼠已建立超过32 000个品系[1],美国[2]、欧洲[3]和日本[4]先后建立冷冻胚胎和精子保存库代替传统的连续繁殖方式,以保护、保存小鼠这一重要遗传资源,并预防小鼠资源流失和重复性工作[5]。美国杰克逊实验室具有世界上最丰富的小鼠资源和最大的冷冻胚胎保存库[6],我国也先后成立国家啮齿类实验动物种子中心和国家遗传工程小鼠资源库[7],并建立了大型低温冷冻库。……
