弗氏链霉菌tylF基因的克隆及其生物信息学分析
2016-06-27闫明亮
闫明亮
(中国人民解放军海军工程大学电气工程学院,湖北武汉 430000)
弗氏链霉菌tylF基因的克隆及其生物信息学分析
闫明亮
(中国人民解放军海军工程大学电气工程学院,湖北武汉 430000)
摘要[目的]研究弗氏链霉菌tylF基因的克隆及其生物信息学分析。[方法]利用RT-PCR技术、巢式PCR技术和RACE技术从弗氏链霉菌B-62169菌株中克隆获得tylF基因的全长cDNA序列,并对其生物信息学进行分析。[结果]经Vector NTI 11.0软件拼接获得tylF基因全长cDNA序列长度为1 245 bp,并带有19 bp长的Poly(A)尾巴,包含927 bp的开放读码框(ORF),编码一个含309个氨基酸残基的蛋白质。生物信息学分析结果表明,tylF基因编码的酶是大菌素-O-甲基转移酶,参与分子功能中甲基转移酶活性和生物学途径中甲基化过程。对tylF基因全长cDNA序列进行蛋白质结构域分析,证实该基因编码TylF蛋白,并具有223个氨基酸蛋白结构域。[结论]该研究为阐明泰乐菌素生物合成过程中甲基化反应机理,更进一步研究大环内酯类抗生素生物合成代谢途径提供生物信息学数据支持。
关键词tylF;泰乐菌素;弗氏链霉菌;基因克隆
链霉菌(Streptomyces)属于放线菌目链霉菌科原核生物,是一类具有丝状分枝细胞的革兰氏阳性细菌[1]。泰乐菌素[2](Tylosin),又名泰乐星,是一类16元大环内酯类畜禽专用抗生素,其产生菌[2]有弗氏链霉菌(Streptomyces fradiae)、龟裂链霉菌(Streptomyces romosus)和吸水链霉菌(Streptomyces hygroscopicus),其中弗氏链霉菌是泰乐菌素的主要产生菌,同时也是工业化生产泰乐菌素的工程菌株。泰乐菌素是一种畜禽专用抗生素,其主要用于饲料添加剂和动物治疗如猪气喘病、鸡慢性呼吸道病、动物消化道疾病、地方性动物支气管炎等,能明显促进禽畜生长、提高饲料利用率[3]等,具有广阔的市场前景。……
