猫杯状病毒的分离鉴定及其全基因组的序列分析
2016-06-07杨文娟李法凯赵卫锋周华波李瑞凯梁明丽韦红云何剑桥韦祖樟黄伟坚
何 平,杨文娟,李法凯,赵卫锋,周华波,李瑞凯,梁明丽,韦红云,何剑桥,祝 健,韦祖樟,黄伟坚,陈 樱
(1. 广西大学 动物科学技术学院,南宁 530004;2. 南宁市华波宠物医院,南宁 53004)
猫杯状病毒的分离鉴定及其全基因组的序列分析
何 平1,杨文娟1,李法凯1,赵卫锋1,周华波2,李瑞凯1,梁明丽1,韦红云1,何剑桥1,祝 健1,韦祖樟1,黄伟坚1,陈 樱1
(1. 广西大学 动物科学技术学院,南宁 530004;2. 南宁市华波宠物医院,南宁 53004)
摘 要:本研究采用MDCK细胞从养殖场患病猪的鼻拭子样品中分离获得1株猫的杯状病毒(Feline calicivirus,FCV),命名为GX01-2013。采用RT-PCR方法扩增了该毒株的全基因组,并进行了序列测定和分析。结果表明,该毒株基因组全长7704 bp,与哈尔滨分离株HRB-SS较为相近,其核苷酸同源性为82.3%。根据FCV衣壳蛋白构建的遗传进化树分析,发现该病毒与F9、F4、225和2024疫苗株均不在同一分支,氨基酸同源性为84.2%~87.7%,各毒株间无明显地域差异。此外,VP1蛋白的E区(426~521aa)发现有4个中和性抗原位点发生改变。
关键词:猫杯状病毒;全基因组;遗传进化分析
猫杯状病毒(Feline calicivirus,FCV)属于杯状病毒科,杯状病毒属,单股正链RNA病毒,是一种主要引起猫科动物多发性口腔和呼吸道疾病、慢性胃炎的重要病原[1],由于病毒株毒力强弱及动物抵抗力的不同,有些病毒株引起猫的急性关节炎、肠炎、肺炎及跛行综合征等[2]。目前认为猫杯状病毒呈世界性分布,其在猫科动物中具有高度的传染性,猫及某些野生动物猎豹[3]、虎[4]和狮[5]等对其均有易感性,症状的严重程度随病毒毒力的强弱和动物年龄的差别而不同,但以一岁以下的猫易感性最高,也有感染狗的报道[6]。……
