周岁细毛羊羊毛长度、产毛量与体质量的全基因组关联分析
2016-06-06刘剑锋徐新明拉扎特艾尼瓦尔于丽娟
狄 江,刘剑锋,徐新明,王 琼,拉扎特·艾尼瓦尔,于丽娟
(1. 新疆畜牧科学院, 乌鲁木齐 830000; 2.中国农业大学 动物科技学院, 北京 100193)
周岁细毛羊羊毛长度、产毛量与体质量的全基因组关联分析
狄江1,刘剑锋2,徐新明1,王琼1,拉扎特·艾尼瓦尔1,于丽娟1
(1. 新疆畜牧科学院, 乌鲁木齐830000; 2.中国农业大学 动物科技学院, 北京100193)
摘要为检测影响周岁细毛羊羊毛长度、毛量及体质量性状的基因组区域,利用OvineSNP50 BeadChip对365只中国美利奴(新疆型)个体基因分型,并采用single-locus回归方法进行全基因组关联分析。通过基因组水平的Permutations校正,检测到2个与羊毛长度及3个与毛量显著关联的SNPs。这些SNPs分别邻近5个已知基因(9.16 ~143.32 kb)。其中FIBIN、 HSD17B11及 PIAS1 3个基因参与羊毛生长、发育相关的生物学过程,且均包含于已知羊毛性状相关QTL区域内,为所检测到的关联结果提供进一步证据。对这些目标区域的进一步研究有助于揭示细毛羊羊毛长度、产量等性状的遗传机理。
关键词全基因组关联分析;羊毛;体质量;细毛羊
通过育种手段不断改善羊毛产量、羊毛长度、纤维直径及体质量性状是提高细毛羊综合品质和养殖效益的重要途径之一,详细了解这些经济性状的分子遗传机理,有助于加快育种进展、提高育种效率。过去20余年里,QTL方法已被普遍应用检测经济性状功能候选区域,然而截至目前在羊SheepQTLdb数据库中仅仅包括789个 QTLs,其中34个QTLs与羊毛性状连锁(http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/index)。而且,由于QTL较大的置信区间,难以鉴别影响这些经济性状的特定基因。对于体质量性状,也仅发现MSTN(Myostatin)[1]、CLPG(Callipyge)[2]及MHC[3]等几个候选基因与绵羊生长及肌肉性状连锁。……
