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从江香猪CYP2A19基因单核苷酸多态性的群体遗传学分析

2016-05-30杨家大任琼吴声榕

南方农业学报 2016年7期

杨家大 任琼 吴声榕

摘要:【目的】评估从江香猪CYP2A19基因的纯合度及遗传变异,为开发从江香猪药物代谢模型積累基础资料。【方法】应用SNaPshot检测方法对141份从江香猪样本CYP2A19基因编码区rs323914689、rs81217981、rs333289891、rs343272409位点及3'端非翻译区rs338584662和rs321736682位点进行分型分析,并计算从江香猪种群的基因型频率、等位基因频率、有效等位基因数(Ne)、杂合度(He)、多态位点数及多态位点百分比。【结果】除rs333289891位点表现为单态外,其余5个位点均检测到2种或3种基因型,多态位点百分比为83.33%。χ2检验结果显示,5个多态位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。5个多态位点的Ne介于1.0071~1.3129,He介于0.0071~0.2057。【结论】不同品系猪种由于遗传背景差异而具有不同的单核苷酸变异,其药物代谢特性也因此存在差异。从江香猪群体纯合度高、遗传稳定性好、变异程度低,是其作为药物代谢动物模型的关键基础。

关键词: 从江香猪;CYP2A19基因;多态位点;遗传学分析

中图分类号: S828.89 文献标志码:A 文章编号:2095-1191(2016)07-1209-07

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【研究意义】从江香猪产于贵州省从江县,是我国稀有的优良地方微型猪种,其个体矮小,早熟易肥,肉肥而不腻,经白水煮熟后味香、汤清甜、肉质细嫩,是制作高档肉制品的理想材料。同时,因其体型矮小,解剖学特性、生理学生化学指标与人类相似,基因纯合,近交不退化,是较理想的实验动物模型(杨秀江,2002),在药物评价中具有广阔的应用前景。细胞色素氧化酶P450(Cytochrome P450 enzymes,CYP)是一类含亚铁血红素的超基因家族酶系,参与机体内生物转化的I相代谢反应,通过氧化方式可将水溶性差的内、外源性物质转变为水溶性强的物质,而进入II相代谢反应,在药物及异源物质的代谢过程中发挥重要作用(张慧锋等,2005;华……

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