不同种类鱼中snrpc的组织表达特征研究
2016-05-17王红莹方瑞
王红莹+方瑞


摘 要:为了深入研究鱼类RNA剪接相关基因snrpc的作用机制,实验应用RT-PCR研究了斑马鱼成鱼组织中snrpc mRNA的表达模式,并比较分析了鲫鱼中snrpc的表达。结果显示,斑马鱼snrpc在垂体和卵巢中有表达,而鲫鱼中在肾脏、垂体和卵巢中有表达,表明snrpc在不同鱼类中具有组织表达的差异性。
关键词:斑马鱼;snrpc;组织表达分析
中图分类号 S965.299 文献标识码 A 文章编号 1007-7731(2016)08-21-02
Abstract:In order to further study the mechanism of fish's snrpc relevant to RNA splicing,we researched the expression of mRNA in zebrafish's and crucian carp's tissues by RT-PCR. Zebrafish's snrpc expression in the pituitary and oocyte,while the crucian carp's expression in kidney pituitary and oocyte. Preliminary results show that zebrafish's snrpc has specific expression in different tissue.
Key words:Zebrafish;Snrpc;Tissue distribution
在负责RNA剪切的因子中,snRNP蛋白是最关键的一类。SNRPC是snRNP蛋白中的一种,但至今研究仍较少。在鱼类早期发育过程中,细胞的快速分裂需要RNA的正确剪切,推测SNRPC在此过程中发挥着重要的功能。本研究中应用RT-PCR研究斑马鱼以及经济鱼类鲫鱼成鱼组织中snrpc mRNA的表达模式,以期进一步揭示SNRPC的作用机制。
1 材料与方法
1.1 实验材料 (1)实验品种:斑马鱼、鲫鱼。(2)主要仪器及设备:Sequi-Gen电泳仪系统,Bio-RabGONGSI;定量移液器,Gilson;凝胶成像系统,Bio-RabGONGSI;PCR仪,Bio-RabGONGSI;恒温摇床、隔水式恒温培养箱、低温水浴锅、高速冷冻离心机、超净工作台、恒温水浴锅,上海精宏。(3)主要试剂:PCR taq酶,TaKaRa;限制性内切酶,NEB;质粒提取试剂盒、PCR纯化试剂盒、酶切胶回收试剂盒,上海生工;Trizol、逆转录试剂盒,TOYOBO。
1.2 实验方法
1.2.1 snrpc基因引物的设计 根据NCBI上预测的snrpc的全长序列,利用primer 5.0设计引物。
1.2.2 mRNA及蛋白表达水平的检测
1.2.2.1 斑马鱼及鲫鱼中各组织总RNA的提取及cDNA合成 斑马鱼和鲫鱼各10条,分别取心脏、肝脏、肾脏、脾脏、脂肪、肌肉、垂体、下丘脑、端脑、小脑、延髓、精巢、卵巢50~100mg,各加600μL TRIZOL;研磨并静置3min,加氯仿抽提,离心后将上清液转到新Rnase-free EP管中,在管中加入等体积的异丙醇沉淀;……
