青南高原多房棘球蚴myophilin基因的克隆和序列分析*
2016-04-19何顺伟张耀刚李超群魏晓星
何顺伟,张耀刚,李超群,彭 源,魏晓星,#
(1.青海大学生态环境工程学院;2.青海大学医学院基础医学部,青海 西宁 810016 )
青南高原多房棘球蚴myophilin基因的克隆和序列分析*
何顺伟1,张耀刚2,李超群2,彭 源2,魏晓星1,2#
(1.青海大学生态环境工程学院;2.青海大学医学院基础医学部,青海 西宁 810016 )
目的 克隆多房棘球绦虫(Em)的myophilin基因并对其序列进行分析与预测。方法 提取Em原头节总RNA,采用RT-PCR技术扩增myophilin基因,将PCR产物连接入pGM-T载体,转化入DH 5α感受态细胞,挑选阳性克隆送测序。采用生物信息学软件对测序结果进行序列比对分析,同时预测编码蛋白的理化性质、二级结构、三级结构、翻译后修饰位点、结构域和抗原表位。结果 扩增出长度为576 bp的cDNA片段,包含完整开放阅读框(ORF),编码190个氨基酸,与已知细粒棘球绦虫的序列同源性达99%。预测结果显示,编码蛋白分子式为C935H1519N255O285S11,理论分子质量为212 876,PI为8.66。α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲在二级结构中所占的比例分别为51.58%、10.00%和38.42%。含有10个翻译后修饰位点,各1个Calponin结构域和CH结构域,8个B细胞抗原表位和6个T细胞抗原表位。结论 成功克隆出Em的myophilin基因并对其进行了有效分析和预测。
多房棘球蚴 亲肌肉抗原 基因 克隆 序列 分析
细粒棘球绦虫(Echinococcosis granulosa,Eg)和多房棘球绦虫(Echinococcus multilocularis,Em)的幼虫感染机体可分别引发囊型包虫病(Cystic echinococcosis,CE)和泡型包虫病(Alveolar echinococcosis,AE),是我国西北畜牧地区流行的人畜共患寄生虫病。近年来,免疫诊断和疫苗预防研究是包虫病防控研究的重点[1]。而寻找灵敏特异的抗原是包虫病免疫诊断和疫苗预防的基础和前提[2]。……
