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浅谈异构生物信息数据库的整合

2016-04-11李晶

生物技术世界 2016年3期
关键词:数据库生物信息

李晶

(江苏农牧科技职业学院 江苏泰州 225300)

浅谈异构生物信息数据库的整合

李晶

(江苏农牧科技职业学院 江苏泰州 225300)

近年来世界范围内展开了HGP即人类基因组计划,由此出现了大量生物学数据,如蛋白质数据、RNA、DNA等,为了便于研究的展开,便于科学家进行数据查询,这些数据需经过有效的处理与整合,然后纳入到生物信息数据库中。数据异构是生物数据分析与处理中需要解决的主要问题之一,文中将对生物信息资源利用面临的问题进行探究,并对以XML为基础的异构生物信息数据库整合模式进行分析。

异构生物 信息数据库 整合

生物信息学属于生命科学,这一科学以计算机技术为基础对有关生物学的数据信息进行存储、分析与整合,通过对其中有效信息的提取,人们可以找出数据对应的生物学意义,这对人类的生存与发展是有着极为重要的意义的。异构数据是整合生物数据库中面临的主要难题之一,整合的主要目的是为了避免语法异构与语义异构出现冲突与差异,保证数据的统一,对这一问题的研究有着重要的现实意义。

1 生物信息资源利用面临的问题

生物信息学在近年来取得了极大的发展,大量数据信息涌现,如何对数据进行筛选与管理是相关人员必须考虑的问题,生物学数据可分为多个种类,数据信息结构复杂,因此其检索与存储方式也各异,为了提高工作效率,促进生命科学研究的展开,应当对数据分析、数据处理、数据管理等技术予以创新。……

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