APP下载

新一代基因组编辑技术
——NgAgo-gDNA

2016-04-10曹玉锦

生物学教学 2016年11期
关键词:靶位碱基课题组

杨 洁 曹玉锦

(山东省枣庄市薛城奚仲中学 277000)(中国科学院青岛生物能源与过程研究所 266101)

2016年5月2日,生物学领域顶尖刊物《自然-生物技术》发表了我国河北科技大学韩春雨等的研究成果《DNA-guided genome editing using the Natronobacterium gregoryi Argonaute》[1],该论文提出一种新的基因组编辑技术NgAgo-gDNA。

1 什么是基因组编辑技术

基因组编辑技术(genome editing)是指对基因组进行定点修饰的遗传操作技术[2]。利用该技术,可以精确地定位到基因组的某一位点上,实现对特定DNA片段的敲除、插入等操作。该技术通过在特定的靶向序列处引入断裂的DNA双链,继而利用细胞自身的修复机制完成修复,从而达成修改并编辑原有的基因组的目的。与传统的同源重组技术和胚胎干细胞技术相比,基因组编辑技术具有快速、操作便捷、成本较低等优势,为基因治疗、生物遗传改造等领域开辟了新的途径。

基因组编辑技术迄今为止仅有20年左右的历史,但在近十年取得突破性进展,目前已提出的基因组编辑策略包括ZFN技术、TALEN技术、CRISPR/Cas9技术以及本文着重介绍的NgAgo-gDNA技术。

2 新一代基因组编辑技术——NgAgo-gDNA

NgAgo-gDNA是Natronobacterium gregoryi Argonaute - guide DNA的简称,Natronobacterium gregoryi是格氏嗜盐碱杆菌;Argonaute(Ago)是一种核酸内切酶;gDNA 即向导DNA。2004年,荷兰学者发现来自嗜热菌的Ago可以有效地利用5′磷酸化的单链DNA作为gDNA,对基因组进行定点切割造成其双链断裂[2](但该酶需要在>65°C的条件下才具有活性,限制了其在生物体中应用的可能性)。韩春雨课题组在此基础上,通过数据库比对,找到了来自格氏嗜盐碱杆菌的Ago(NgAgo),该蛋白在生理条件下即具有很好的酶切活性,可以在多种哺乳动物细胞中实现gDNA介导的基因组的切割(图1),并且能够实现在基因组中插入目的DNA片段的能力,是一种高效快捷的基因组编辑工具[1]。

根据韩春雨课题组的研究结果,NgAgo-gDNA与CRISPR/Cas9技术相比具有以下特点:①向导设计制作简便:gDNA设计方便,可以像合成PCR引物一样由公司合成,输送方式直接,直接转染细胞:②编辑对象所受限制小:Cas9需要与基因组上19个碱基配对,并要求在这组碱基后紧邻一个特定的PAM序列,一定程度上限制了靶位点的选择范围,而NgAgo-gDNA技术中靶位点的选择则不受PAM序列的限制,几乎能编辑基因组内任何位置;③编辑精准度更高:与NgAgo结合的gDNA长度为24个碱基,这比与Cas9结合的19个碱基的gRNA要长5个碱基,理论上其精确性可以提高45倍;NgAgo-gDNA系统对gDNA靶序列错配容忍度很低;同时,向导核酸是DNA而非RNA,避免了RNA形成复杂的二级结构而带来的失效或者脱靶效应。与CRISPR/Cas9技术相比,目前NgAgo-gDNA的劣势在于:①无法使用质粒或慢性病毒载体输送gDNA;②gDNA不能再改造,而gRNA可以连接一段RNA不影响功能。

图1 NgAgo-gDNA技术原理示意图

3 NgAgo-gDNA技术的启示

NgAgo-gDNA是我国学者首创的尖端生物技术,被誉为第四代基因组编辑技术,打破了国外基因组编辑技术的专利垄断。但该技术还需要后续工作进行验证和进一步的改进。

猜你喜欢

靶位碱基课题组
阳城县“耕心微写”课题组
应用思维进阶构建模型 例谈培养学生创造性思维
原科技大学新能源开发与应用课题组介绍
中国科学家创建出新型糖基化酶碱基编辑器
生命“字母表”迎来4名新成员
生命“字母表”迎来4名新成员
利用CRISPR/Cas9技术敲除水稻Pi21基因的效率分析
课题组成员
CT引导下靶位注射胶原酶治疗腰椎间盘突出症36例
耐喹诺酮铜绿假单胞菌药物作用靶位改变的研究