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汉中黑稻黄烷酮3-羟化酶基因(F3H)的遗传变异分析

2016-03-21尹亚军路宏朝

西南农业学报 2016年10期
关键词:水稻植物研究

张 涛,尹亚军,路宏朝,王 令

(陕西理工学院生物科学与工程学院,陕西 汉中 723000)

汉中黑稻黄烷酮3-羟化酶基因(F3H)的遗传变异分析

张 涛,尹亚军,路宏朝,王 令

(陕西理工学院生物科学与工程学院,陕西 汉中 723000)

本实验通过PCR和测序拼接获得汉中地区8个黑稻品种黄烷酮3-羟化酶基因(F3H)编码区序列,在NCBI中用BLAST分析首次发现该基因位于水稻4号染色体。发现8种黑稻和普通籼稻F3H序列完全相同,与粳稻相比较,则存在4个突变位点,导致2个氨基酸突变。基于F3H序列信息的进化树表明黑稻与籼稻、粳稻、小麦、玉米的亲缘关系较近;遗传距离和同源性分析表明F3H基因较为保守,是一个古老的基因,可用于种属的鉴定分析。F3H蛋白理化性质分析发现,黑稻与其它禾本科植物存在一定差异,蛋白三维结构及相关位点预测发现粳稻和黑稻无明显差异,初步认为黑稻F3H序列变异可能与花青素的合成无关,需要在其表当量与花青苷和成合成与沉积的关系方面开展进一步研究。

黑稻;黄烷酮3-羟化酶;序列分析;遗传变异

水稻是主要的粮食作物,存在籼稻和粳稻2个变种,籼稻和粳稻中有部分群体的果皮层、种皮和米粒表现为黑色,研究发现黑色与花青素含量和结构有关,这一群体被称为黑稻,是稻种资源库中极具特色而又名贵的类群[1]。由于稻米中富含天然花青素和较多的蛋白质、氨基酸及微量元素,因而具有较高的营养保健功能和经济价值,备受人们关注[2]。学者对于水稻中花色素苷的合成机制进行了大量研究,以期揭示其代谢调控机理,为水稻的育种和种质资源保护提供指导与借鉴[3-4]。……

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