王果平，樊丛照，罗红梅，季爱加，宋 骏，李晓瑾＊＊

（1.新疆维吾尔自治区中药民族药研究所 乌鲁木齐 830002；2.中国医学科学院 中国协和医科大学 药用植物研究所 北京 100193)

濒危药用植物新疆阿魏cDNA文库构建与微卫星标记＊

王果平1，樊丛照1，罗红梅2，季爱加2，宋 骏1，李晓瑾1＊＊

（1.新疆维吾尔自治区中药民族药研究所 乌鲁木齐 830002；2.中国医学科学院 中国协和医科大学 药用植物研究所 北京 100193)

目的：测试和分析新疆阿魏转录组，挖掘基因表达谱多态性标记（EST-SSRs），为新疆阿魏属植物遗传多样性、生物学特性、功能基因鉴定和濒危机制的研究奠定基础。方法：提取新疆阿魏茎叶总RNA，反转录合成cDNA，应用454 GS FLX Titanium进行测序，并对其序列进行拼接，获得一致性序列（Unique Sequences）；使用Simple Sequence Repeat Identification Tool（Perl Script）对一致性序列进行分析，检索SSRs模体，采用Primer 5及SSR Hunter软件设计引物并进行PCR扩增。结果：高通量测序获得新疆阿魏ESTs序列550 200条，经拼接得到60 248条Unique Sequences，从中发现1 916个EST-SSRs，平均每100 kb出现3.18个SSR，其中二核苷酸最多，GA重复最常见，随机挑选5条序列扩增及测序结果表明，80%的SSR位点与Sanger测序结果一致。结论：通过转录组测序首次获得新疆阿魏EST-SSRs，为新疆阿魏生物学特性及濒危机制研究奠定了基础。

新疆阿魏 EST-SSRs 高通量测序 分子标记

药材阿魏为伞形科阿魏属植物花茎中具有特殊气味的油胶树脂，欧亚多国皆有阿魏的药用历史。在中国，阿魏最早收载于《唐本草》（公元659年），其后历代本草均有记载，具有解痉、祛风、止泻、除肠虫、治疗哮喘、癫痫及抗流感等功效[1-12]。《中华人民共和国药典》收载新疆阿魏Ferula sinkiangensis为阿魏药材基原植物之一，仅分布于中国新疆伊犁地区。……