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基于线粒体COⅠ基因序列的辽宁沿海细纹子鱼群体遗传多样性分析

2016-03-09李玉龙刘修泽李轶平王爱勇王小林

海洋渔业 2016年2期

李玉龙,刘修泽,李轶平,王爱勇,王小林,董 婧

(辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋生物资源与生态学重点实验室,大连 116023)

李玉龙,刘修泽,李轶平,王爱勇,王小林,董 婧

(辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋生物资源与生态学重点实验室,大连 116023)

细纹子鱼(Liparis tanakae)主要分布于西北太平洋海域的朝鲜半岛、日本和我国渤海、黄海和东海,已成为黄渤海渔业资源的优势种类之一,并在黄渤海生态系统中的扮演着越来越重要的角色。因此,有必要对这一生态优势种的种群状况及遗传背景进行了解。根据线粒体COⅠ基因序列对辽宁沿海不同体色花纹的细纹子鱼辽东湾群体(n=20)和黄海北部群体(n=34)的遗传多样性和群体遗传结构进行了分析。结果表明,长度为623 bp的COⅠ基因片段,其A、T、G、C碱基的平均含量分别为22.3%,32.4%,26.9%,18.4%。在2个群体54 ind个体中共检测得到8个单倍型,其单倍型间遗传差异为0.2%~0.6%。两个群体的单倍型多样性指数和核苷酸多态性指数分别在0.56±0.06和0.70±0.05、0.001 0±0.000 9和0.001 7± 0.001 3之间。分子方差分析显示两群体间无遗传分化。核苷酸不配对分析表明,细纹子鱼群体在50 000~116 000年前经历了群体扩张。

细纹子鱼;线粒体COⅠ基因;遗传多样性;遗传结构

1 材料与方法

1.1 样品采集

图1 子鱼样品取样站位图Fig.1 Sampling locations of snailfishes

1.2 DNA提取、扩增及测序

采用酚/氯仿抽提法从肌肉组织中提取基因组DNA。采用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增了COⅠ基因部分序列片段。所用正向引物和反向引 物序列 分别为COⅠ a:5′-cctgcaggaggaggagaycc-3′和COⅠ b:5′-atgcatatctatctgccattttag-3′[22]。

反应体系25μL,包括:0.2 mmol·L-1每种dNTPs,0.2μmol·L-1每种引物,1μL DNA模板,1 U Taq,2.0 mmol·L-1MgCl2,2.5μL 10×缓冲液,灭菌超纯水补足剩余体系。……

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