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锦鲤疱疹病毒ORF72基因克隆及结构功能分析

2016-02-07王世会贾智英李池陶孙志鹏石连玉

水产学杂志 2016年3期
关键词:分析

王世会,贾智英,李池陶,孙志鹏,石连玉

(中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江 哈尔滨 150070)

锦鲤疱疹病毒ORF72基因克隆及结构功能分析

王世会,贾智英,李池陶,孙志鹏,石连玉

(中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江 哈尔滨 150070)

于辽宁丹东采集感染锦鲤疱疹病毒的活鲤Cyprinus carpio样品,经DNA提取、PCR扩增、重组质粒构建步骤成功克隆锦鲤疱疹病毒ORF72基因,并利用生物信息学软件分析ORF72蛋白结构与功能,构建系统进化树。结果显示:ORF72基因开放阅读框共1113bp,编码蛋白由370个氨基酸组成,理论相对分子质量为40.5KD;ORF72蛋白主要由α螺旋、β折叠、无规则卷曲3种二级结构组成;N端35个氨基酸序列为信号肽序列。跨膜结构分析表明:ORF72蛋白无跨膜区,保守结构域预测表明ORF72含有一个保守结构域,抗原表位分析表明,抗原性较好。结构预测显示:ORF72氨基酸序列存在2个潜在的N-糖基化位点、1个潜在的O-糖基化位点、19个潜在的磷酸化位点。系统进化树分析发现,其与锦鲤疱疹病毒美国株、以色列株属同一分支。

锦鲤疱疹病毒;ORF72基因;结构功能分析

鲤Cyprinus carpio是全世界养殖最广泛的淡水鱼,养殖地区主要分布在亚洲、欧洲和中东地区,其中锦鲤Cyprinus carpio koi是重要的观赏性鱼类[1]。20世纪末开始爆发的锦鲤疱疹病毒病(koi herpes virus disease,KHVD)严重影响了鲤和锦鲤养殖业的发展[2]。该病传染性和致病性高,主要感染鲤和锦鲤[3],临床表现为行动缓慢,鳃出血并伴有大量坏死,尾鳍基部充血,皮肤疱疹性损伤与侵蚀[1]。在水温18~28℃时均可发病,其中22~24℃病毒感染力最强[4]。……

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