宋志芳，曹洪战，2*，芦春莲，2

（1.河北农业大学动物科技学院，河北 保定 071000；2.河北农业大学猪业科学研究所，河北 保定 071000）

全基因组关联分析及其在猪育种中的研究进展

宋志芳1，曹洪战1，2*，芦春莲1，2

（1.河北农业大学动物科技学院，河北 保定 071000；2.河北农业大学猪业科学研究所，河北 保定 071000）

近年来，随着高通量单核苷酸芯片和基因分型技术的不断发展，利用全基因组关联分析猪的性状成为可能。全基因组关联分析是一种新兴的遗传分析方法，能有效进行复杂疾病和性状的研究。国内外相关研究人员针对猪性状进行全基因组关联分析，积累了大量的单核苷酸多态性（SNP）标记、候选基因以及数量性状位点，为猪分子育种提供基础。该文主要对全基因组关联分析的基本原理、分析方法以及对猪性状的研究进展进行综述。

全基因组关联分析；数量性状位点；SNP标记；多重检验

我国是一个猪生产和消费大国，国内对猪肉的需求量巨大。最新数据显示，2015年我国生猪出栏数为7.082 5亿头，猪肉产量5 487万t。预计2016年我国生猪出栏规模是6.15亿头，农业部4月份公布了我国能繁母猪存栏数是3 771万头。如此大规模的饲养和出栏规模，如果能够很好地针对猪的重要经济性状进行遗传改良，必然会带来良好的经济效益。然而，有些数量性状如生长性状遗传力低或难以准确度量，利用传统的育种方法耗时且进展缓慢，准确度不高。猪的60k高密SNP芯片已经实现了商业化应用，能使基因组基因定位的精确度提高，并且对猪的体型外貌[1]、生长[2-4]、肉质[5-8]、繁殖[9-11]及行为[12]等多种性状进行全基因组关联分析（GWAS），能够进一步深入了解性状的遗传基础。……