孙　妍，陈高瞻，占卫红，雷　航，王心倩，余晓丽

(武汉轻工大学 生物与制药工程学院，湖北 武汉 430023)



非结核分枝杆菌MmpL家族同源性分析及拓扑结构预测

孙妍，陈高瞻，占卫红，雷航，王心倩，余晓丽

(武汉轻工大学 生物与制药工程学院，湖北 武汉 430023)

摘要：以非结核分枝杆菌中的胞分枝杆菌、鸟分枝杆菌和耻垢分枝杆菌三个标准株为研究对象，对其MmpL家族蛋白的同源序列进行相似性分析和功能预测。根据NCBI数据库中分枝杆菌MmpL蛋白序列进行多重序列比对；用TMHMM Server 2.0在线软件对MmpL同源序列进行拓扑结构预测；用Interproscan对MmpL3同源序列进行保守序列和结构域分析。同源分析结果显示：与H37Rv MmpL家族比较，胞分枝杆菌中没有发现MmpL2、MmpL6、MmpL7、MmpL8、MmpL9、MmpL12和MmpL13的同源序列；鸟分枝杆菌没有发现MmpL6、MmpL7、MmpL8、MmpL9、MmpL12和MmpL13的同源序列；耻垢分枝杆菌没有发现MmpL2、MmpL7、MmpL9、MmpL10、MmpL12和MmpL13的同源序列，推测可能与菌种差异性有关；拓扑结构预测发现大部分同源序列跨膜次数与H37Rv的对应MmpL蛋白保持一致，少数序列与H37Rv的对应MmpL蛋白有较小偏差；保守序列分析发现：与H37Rv比较三个标准株的MmpL3同源序列有两个膜转运蛋白结构域(MMPL domain)，没有固醇敏感多肽区(SSD domain)说明该同源序列有膜转运功能，无SSD介导的胆固醇自我平衡调节、物质运输以及细胞信号转导等功能。研究结果为进一步阐明非结核分枝杆菌的毒力、致病机制和疾病趋势提供基础资料。

关键词：非结核分枝杆菌；MmpL家族蛋白；同源序列；拓扑结构

1引言

非结核分枝杆菌(NontuberculosisMycobacteria，NTM)是指结核分枝杆菌复合群(M.tuberculosscomplex)、麻风分枝杆菌(M.leprae)以外的分枝杆菌。其中部分是致病菌或条件致病菌，临床上能引起人类疾病的主要有堪萨斯分枝杆菌、鸟分枝杆菌、胞分枝杆菌、龟分枝杆菌、脓肿分枝杆菌等10余种[1]。……