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西藏藏猪遗传多样性研究

2015-10-24郭永博蔡原

生物技术通报 2015年5期
关键词:研究

郭永博 蔡原

(甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州  730070)

西藏藏猪遗传多样性研究

郭永博 蔡原

(甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州 730070)

采用mtDNA D-loop作为分子标记,对西藏的4个藏猪群体(林芝、山南、昌都和日喀则)遗传多样性进行了研究。结果表明,西藏藏猪mtDNA D-loop高变区A+T含量(62.90%)明显高于 G+C 含量(37.1%),富含A和T,存在碱基偏倚性。在长度为435 bp的序列中,共检测到20个变异位点,界定了26个单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.705±0.021,平均核苷酸差异数(k)为1.231,核苷酸多样度(Pi)为0.002 83。其中,Hd、k和Pi在昌都藏猪群体中最高,日喀则藏猪最低。此外,Hap1和Hap3单倍型是4个群体的共享单倍型,表明4个藏猪群体存在两个共同的母系祖先单倍型。

藏猪;mtDNA D-loop;单倍型;遗传多样性

藏猪是世界上少有的高原型猪种,是唯一能够适应高原海拔气候和以放牧为主的猪种[1]。藏猪主产于青藏高原,包括云南迪庆藏猪、四川阿坝及甘孜藏猪、甘肃的合作猪以及分布于西藏自治区山南、林芝、昌都等地的藏猪类群。由于近年来繁殖育种手段不断改进,高强度选育,加之生态环境的改变,致使许多拥有丰富遗传资源的地方品种数量锐减,纯种藏猪的分布范围和数量正在不断减少,已面临种群灭绝的危险[2]。因此,最大限度地保存藏猪的遗传多样性是藏猪保护与利用面临的突出问题。

mtDNA D-loop,即mtDNA的非编码区,该区的进化速率较其他区域高5-10倍,是目前mtDNA研究的热点,被广泛应用于哺乳动物遗传多样性和种内、种间亲缘关系等方面的研究[3-5],甘佳等[6]以微卫星标记测定了四川境内阿坝、稻城和德格3个藏猪遗传多样性。……

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