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一种小鼠CT图像分割方法

2015-09-18邵萌珠邹辰

软件导刊 2015年8期

邵萌珠 邹辰

摘要:由于microCT图像的成像原理和组织特性导致的多样性和复杂性,针对小鼠CT图像,单一的图像分割方法难以取得良好的分割结果。结合当前医学图像分割方法,提出将阈值分割和基于Amira软件的交互式分割相结合的方法。针对不同的器官组织,根据对象灰度特征、形状、空间分布以及边缘分布等信息,使用不同的分割方法及工具进行逐一分割,最后将不同的器官融合成完整的分割后CT图像。该半自动交互式分割方法结合了两者的特点,可实现小鼠CT图像的准确分割。

关键词:医学图像分割;阈值分割;Amira软件;MATLAB应用

DOIDOI:10.11907/rjdk.151432

中图分类号:TP317.4

文献标识码:A 文章编号文章编号:16727800(2015)008020703

0 引言

在小鼠microCT图像数据获取过程中,如使用液体麻醉剂容易使小鼠的呼吸和心跳运动加快,导致运动伪影的产生,致使microCT图像成像分辨率低,进而降低图像分割的准确性并对后期重建工作造成误差;而可以提高图像分辨率的用于小动物的造影剂价格昂贵,成本较大。基于准确性、快捷性和成本代价适当的原则,本文提出使用阈值分割与交互式分割相结合的分割方法对小鼠microCT图像进行分割。

1 小鼠microCT图像分割

基于小鼠microCT图像特点,分步进行分割:①利用阈值分割方法[13]分割出小鼠的骨骼部分;②利用基于Amira软件的交互式分割方法分割出其它器官;③利用Amira软件对分割后的各切片进行平滑操作;④利用Matlab将各器官融合[4,5]。操作流程如图1所示。

1.1 基于阈值的自动分割

阈值分割法是一种将灰度图像变为二值图像以达到分割目的的方法。……

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