大鳞副泥鳅部分线粒体基因的序列分析研究
2015-08-22韩晓磊朱绿定王富凯韩曜平朱庆华
韩晓磊,王 丹,徐 涛,朱绿定,王富凯,韩曜平,朱庆华
(1.常熟理工学院 生物与食品工程学院,江苏 常熟 215500;2.常州市武进区前黄镇农技农机站,江苏 常州 213100;3.常州市秋余水产养殖专业合作社,江苏 常州 213100)
大鳞副泥鳅部分线粒体基因的序列分析研究
韩晓磊1,王丹2,徐涛1,朱绿定3,王富凯1,韩曜平1,朱庆华3
(1.常熟理工学院 生物与食品工程学院,江苏 常熟 215500;2.常州市武进区前黄镇农技农机站,江苏 常州 213100;3.常州市秋余水产养殖专业合作社,江苏 常州 213100)
通过PCR和DNA测序技术,获得了大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus)线粒体基因组的部分序列,所得4段序列长度共计11552 bp,包括5个蛋白质编码基因(ND1、ND2、ND4、ND4L、ND6和Cytb),14个tRNA基因.本研究获得序列的碱基组成为A 28.9%、C 27.7%、G 15.7%、T 27.7%,可看出(A+T)>(C+G);测出的蛋白编码基因的碱基都有一个明显的现象,就是G的含量很明显的少于其他碱基,而C的含量都比较高,并且(A+T)>(C+G),这样的结果表现出明显的反G偏倚和碱基组成偏好性.将大鳞副泥鳅Cytb序列与GenBank其他6种鱼类的Cytb序列进行%对,表明大鳞副泥鳅与洛东江高丽鳅和俄罗斯泥鳅亲缘关系最近.用NJ法构建7种鱼类的进化关系树,结果表明:大鳞副泥鳅与洛东江高丽鳅和俄罗斯泥鳅最先聚类,再与其他鳅科鱼类相聚,最后与鲤科鱼类斑马鱼相聚,结果与传统分类一致.
大鳞副泥鳅;线粒体DNA;NADH还原酶复合体;Cytb
大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus)隶属于鲤形目,鳅科,花鳅亚科,副泥鳅属,主要分布于四川、江苏、浙江、台湾,辽宁、黑龙江等地,具有很高的食用价值,俗称“水中人参”[1-3].大鳞副泥鳅现已成为我国出口韩……
