桑青枯雷尔氏菌MR111的GspF基因的获取与结构分析
2015-08-20杨金宏
杨金宏


摘要:GspF是细菌Ⅱ型分泌系统的内膜平台的重要蛋白,利用PCR扩增技术,获得了桑青枯雷尔氏菌MR111的含有该类基因功能性结构域的GspF基因。NCBI在线BLASTP分析发现,该基因与雷尔氏菌属来源的同源基因的一致性在90%以上;在聚类分析中,首先所有雷尔氏菌属同源基因聚合在同一分支,后与皮氏罗尔斯顿菌的同源基因聚合。基因结构分析表明,该基因有2个由α螺旋组成的具有高度相似性的、跨膜胞质结构域,揭示该基因可能参与细菌的跨膜分泌。
关键词:桑青枯雷尔氏菌;Ⅱ型分泌系统;GspF基因;结构分析
中图分类号:S888.71+1 文献标志码: A 文章编号:1002-1302(2015)07-0038-03
植物致病细菌Ⅱ型分泌系统(T2SS)是由12~15个分泌途径转膜蛋白(GSP)基因簇为中心组成的复合体,向细胞外分泌毒性因子、胞外酶、毒素等许多重要的蛋白质,通过2步将蛋白从细胞内转移到细胞外[1]。GspF、GspL、GspM、GspE等共同组成T2SS的内膜平台,组装其他分泌元件,控制分泌通道的开启[2]。GspF是内膜平台中具有重要作用、并具有广泛分布的胞质膜蛋白,Thomas等通过分析GspF的氨基酸序列,结合欧文氏杆菌(Erwinia carotovora)的GspF与BlaM融合试验证实GspF穿过内膜3次,其N末端和C末端分别位于细胞质和周质[3]。2007年Arts等进一步通过碱性磷酸酶融合试验证实了绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)中GspF的同源物的拓扑结构,证实了GspF是一个质膜蛋白[4]。2009年,Abendroth等对来自霍乱弧菌(Vibrio cholerae)的EpsF(GspF的同源基因)的N末端的胞质结构域的晶体结构进行了解析,其由6个反向平行α螺旋组成。2个分子EpsF蛋白的N-末端结构域形成1个紧密的二聚体并具有保守的结合界面[5]。……
