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贵州本地山羊STAT5A基因第10外显子SNP研究

2015-08-20谢海强孙岩岩盘道兴钱成康建兵胡

江苏农业科学 2015年7期

谢海强 孙岩岩 盘道兴 钱成 康建兵 胡玲玲 龚俞 焦仁刚 刘若余

摘要:利用黔北麻羊、贵州黑山羊和贵州白山羊构建DNA池,设计1对引物扩增其STAT5A基因第10外显子及部分内含子序列。PCR产物纯化后进行双向测序。DNAStar和BLAST分析确定多态性位点。利用生物信息学软件分析SNPs位点对STAT5A基因RNA二级结构、STAT5A蛋白二级及三级结构的影响。结果表明:在扩增的STAT5A基因中筛选到3个SNPs:C-32A、G+71A和G+158A,其中G+71A为错义突变,导致编码的丙氨酸(Ala)变为苏氨酸(Thr);C-32A和G+158A均在内含子区,不参与氨基酸编码。SNPs位点对STAT5A基因RNA二级结构和STAT5A蛋白结构均有一定影响。

关键词:STAT5A基因;SNPs;外显子;贵州本地山羊

中图分类号: S827.2 文献标志码: A 文章编号:1002-1302(2015)07-0030-03

收稿日期:2014-07-24

基金项目:贵州省重大科技专项计划(编号:黔科合重大专项字[2011]6009号);黔西南州种草养羊产业发展省州科技合作专项(编号:黔西南科合字[2011]5-3号);贵州大学研究生创新基金(编号:研农2014012)。

作者简介:谢海强(1989— ),男,江苏常州人,硕士研究生,研究方向为分子遗传与动物育种。E-mail:xiehaiqiang1115@163.com。

通信作者:刘若余,博士,教授,主要从事分子遗传与动物育种研究。E-mail:liury04@163.com。

STAT5是信号转导和转录激活子蛋白(signal transduction and activator of transcription,STAT)家族中的重要成员之一,它包括STAT5A和STAT5B这2个亚型,其STAT同源性家族成员共有7个,分别为STAT1、STAT2、STAT3、STAT4、STAT5A、STAT5B及STAT6[1]。 在众多家族成员中,STAT5肩负着众多功能,它不仅参与细胞增殖、分化与凋亡的过程,调控细胞周期,还对生物体生长和免疫应答起重要调控作用。STAT5能够实现如此多功能,主要是通过其信号传导机制来完成,主要有JAK2-STAT5[2]、JAK3-STAT5[3]、STAT5-Foxp3[4]等信号通路 。

STAT5A和STAT5B在结构与功能相近,序列具有很高的同源性,它们都拥有高度保守的N端结构域,促进蛋白间相互作用的蜷曲螺旋结构域,能与DNA直接结合的DNA结合结构域,还都具有最具保守性的SH2结构域[5]。……

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