基于cpDNA和rDNAITS片段分析西南地区青杨派杨树的系统发育与进化关系
2015-06-28李佳蔓周安佩何承忠
李佳蔓,员 涛,周安佩,纵 丹,李 旦,何承忠,4*
(1云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室,西南林业大学,昆明650224;2西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室,西南林业大学,昆明650224;3云南生物多样性研究院,西南林业大学,昆明650224;4西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室,西南林业大学,昆明650224)
基于cpDNA和rDNAITS片段分析西南地区青杨派杨树的系统发育与进化关系
李佳蔓1,2,员 涛1,2,周安佩1,2,纵 丹1,2,李 旦3,何承忠1,2,4*
(1云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室,西南林业大学,昆明650224;2西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室,西南林业大学,昆明650224;3云南生物多样性研究院,西南林业大学,昆明650224;4西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室,西南林业大学,昆明650224)
西南地区青杨派杨树种质资源丰富,可为杨树遗传改良提供珍贵的基因资源,但树种之间形态学差异细微,该研究以山杨作为外类群,测定了西南地区及其他地区杨属青杨派17个种(杂种)共36份样本的3个叶绿体片段(atpF-atpH、trnL-F和matK)和核糖体ITS片段,并对其进行系统发育分析,以探讨西南地区青杨派树种的系统进化关系。结果表明:(1)在所有样本中,3个叶绿体片段atpF-atpH、trnL-F、matK的长度分别为605~634bp、957~1 010bp、819bp,3个片段拼接后的联合序列包含29个变异位点和15个信息位点;ITS片段对齐后的长度为646bp,变异位点19个,信息位点17个。(2)基于叶绿体联合序列和ITS片段的杨属青杨派树种的平均遗传距离分别为0.001 3和0.003 6。叶绿体联合片段的MP和Bayes系统树树型基本一致,青杨派树种可以划分为2组,第1组由青杨、三脉青杨、大青杨和辽杨构成;……
