刘雪雪，阿地力江·卡德尔，董坤哲，王月月，潘建飞，浦亚斌，何晓红，马月辉，蒋 琳*

(1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，北京 100193； 2.甘肃农业大学动物科学技术学院，兰州 730070)

德保矮马X染色体选择信号筛选

刘雪雪1，阿地力江·卡德尔1，董坤哲1，王月月1，潘建飞2，浦亚斌1，何晓红1，马月辉1，蒋 琳1*

(1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，北京 100193； 2.甘肃农业大学动物科学技术学院，兰州 730070)

旨在对德保矮马(Debao pony)X染色体的选择信号进行筛选。本研究利用Illumina公司开发的马芯片Equine 65K SNP BeadChip，对德保矮马、伊犁马、蒙古马进行X染色体扫描，获得2 339个SNPs位点。通过群体分化系数FST法和XP-EHH两种不同的方法，分别以伊犁马和蒙古马为对照群体对德保矮马进行X染色体选择信号检测。结果，筛选到两个受到较强选择区域4.0～39.9和87.1～123.5 Mb，包含64个“离群位点”。通过基因注释筛选到PHEX、BCOR、PNPLA4和GPC3等与生长和骨骼发育相关的基因。研究结果发现，德保矮马的选育过程中X染色体很多与生长相关的基因受到了强烈的选择，其中部分在马中未见报道，可以作为研究矮小性状的重要候选基因。

德保矮马；FST；XP-EHH；X染色体；选择信号

动物的生长发育调控机制以及人和动物的矮小机理一直是国内外的研究热点。目前，对小型马的矮小特性的研究报道较少，机理尚不清楚，而且大多数前期研究都集中在常染色体，性染色体相关的研究很少。德保矮马是体高在100 cm以下的小型地方品种资源[1]。在德保矮马的培育过程中，许多重要的性状受到过高强度的人工选择，长期的人工选择使得德保矮马的形态特征得到很大的变化，尤其是能够适应山区的矮小体格。……