大庆龙凤湿地底泥氨氧化细菌与氨氧化古菌多样性分析
2015-03-13马茹霞晏磊王国兴王长虹贾军邓兵沈婷婷王伟东
马茹霞,晏磊,王国兴,王长虹,贾军,邓兵,沈婷婷,王伟东
(1.黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院,大庆 163319;2.上海岩土工程勘察设计研究院有限公司)
硝化作用在地球的氮素循环过程中起重要的作用,其主要包括两个步骤,第一步通过氨氧化菌将氨氧化为亚硝酸盐,第二步通过亚硝酸盐氧化菌将亚硝酸盐氧化为硝酸盐。其中,氨氧化细菌(Ammoniaoxidizing bacteria,AOB)介导的氨氧化作用是其限速步骤,主要由属于变形杆菌门的β-亚纲和γ-亚纲的氨氧化菌来完成[1]。AOB进行的氨氧化作用是由氨单加氧酶(ammoniamonooxygenase,AMO)催化的,编码AMO的基因(amo A,amo B和amo C)分别编码其3个亚基[2]。1997年,Rotthauwe首次使用amo A-PCR方法研究了自养氨氧化细菌群落结构[3],此后,amo A基因被广泛运用于各种生态系统中自养氨氧化细菌的群落结构研究[3]。有研究发现 Nitrosomonas sp.和Nitrosospira sp.为一些堆肥过程中的关键AOB菌群[4],由于Nitrosospira sp.生长速度较慢,目前在活性污泥中很少检测到[5]。研究发现,在海洋和陆地环境的一些嗜温和嗜热古菌中也含有amo A基因的同系物,并且能催化氨氧化反应[6-7],这一发现将参与氮素循环的微生物扩展到了古菌领域。进一步研究表明,海洋中AOA的数量占了整个微生物数量的39%,这些AOA很有可能在海洋环境的硝化作用中起着重要的作用[8-9]。近期,第一株 AOA-Nitrosopumilu smaritimus的成功培养以及古菌amo A基因的mRNA对氨盐添加的响应[6],强有力地证实了AOA在自然界中的真实存在。到目前为止,富集培养AOA已有4种Nitrosopumilu smaritimus[6]、Cenarchaeumsymbiosum[10]、Nitrososphaera gargensis[11]和 Nitrosocaldus yellowstonii[7]。最近,大量的研究发现属于泉古菌门的AOA也能氧化氨,广泛分布于土壤、河口沉积物、牛粪堆肥及污水处理厂等环境中[12],自然界中AOA的多样性和功能研究迅速成为新的研究热点。……
