基于高分辨率熔解曲线技术的CYP2C19、IL-1β基因多态性检测*

洪军波#刘东升舒徐祝荫汪安江谢川谢勇张焜和吕农华&

南昌大学第一附属医院消化内科(330006)

*基金项目：江西省科技计划项目(20113BCB24019)

#Email: allen2005066@sohu.com

背景：细胞色素P450同工酶2C19(CYP2C19)和白细胞介素-1β(IL-1β)基因多态性是幽门螺杆菌(Hp)感染根除率的重要影响因素，明确其基因多态性对根除治疗方案的制定具有指导意义。目的：采用高分辨率熔解曲线(HRM)技术鉴别CYP2C19、IL-1β基因单核苷酸多态性(SNPs)位点基因型。方法：采集200名健康体检者外周血，提取基因组DNA，以HRM技术确定CYP2C19*2、*3和IL-1β-31/-511引物的最佳Mg2+浓度，并检测相应SNPs位点基因型，检测结果以基因测序进行验证。结果：CYP2C19*2、*3和IL-1β-31/-511引物的最佳Mg2+浓度分别为3.0、3.0、2.5、2.5 mmol/L。HRM技术能精确鉴别CYP2C19*2、*3和IL-1β-31/-511基因型，与基因测序结果有良好的一致性(κ=0.985和0.968)。结论：HRM技术能精确鉴别CYP2C19、IL-1β基因多态性，可用于指导Hp根除治疗方案的药物选择。

关键词高分辨率熔解曲线；细胞色素P450 CYP2C19；白细胞介素1β；多态性，单核苷酸；

幽门螺杆菌

Polymorphism, Single Nucleotide;Helicobacterpylori

含质子泵抑制剂(PPIs)的根除治疗方案是目前国内外共识推荐的幽门螺杆菌(Hp)感染处理方法[1]，方案中的PPIs主要由肝脏细胞色素P450(cytochrome P450, CYP)同工酶2C19(CYP2C19)代谢，因此CYP2C19基因多态性引起的酶活性差异可通过影响PPIs代谢而影响Hp根除治疗方案的疗效[2]。促炎细胞因子白细胞介素-1β(interleukin-1β, IL-1β)可通过下调H+/K+ATP酶表达抑制壁细胞分泌胃酸[3]，其基因多态性亦为Hp根除治疗效果的影响因素之一。建立有效的检测方法以明确上述基因多态性，对提高Hp感染根除率具有临床指导意义。高分辨率熔解曲线(high-resolution melting curve, HRM)技术是基于有序列变化的扩增子之间微弱的DNA熔解温度(Tm值)差异，通过DNA片段熔解曲线的差异进行突变检测，方法简单，易于操作，能快速、精确地检测大量样本，并具有成本优势[4-12]。……