马鞍山地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性调查
2014-08-07陈蓉华周豫军
陈蓉华,侯 杰,晏 斌,周豫军
(马鞍山市公安局 刑警支队刑科所,安徽 马鞍山 243000)
采用AmpFISTR Identifiler荧光标记复合扩增系统,对安徽马鞍山地区292名汉族无关个体D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、vWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA 15 个 STR 基因座进行基因分型,并通过PowerStats软件对原始数据进行统计分析,旨在获得马鞍山地区汉族人群的等位基因频率数据,调查该系统在本地区汉族人群中的应用价值。
1 材料和方法
292名无关汉族个体样本均来自马鞍山三县及市辖区,系本实验室日常检案积累。所有血样均用硅珠法[1]提取DNA 后,采用AmpFISTR Identifiler试剂盒(ABI公司),10 μl扩增体系,在9700型扩增仪上对15个STR基因座进行复合扩增,扩增产物用ABI3130xl型遗传分析仪检测,得到STR分型结果。用PowerStats软件(美国Promega公司)对原始数据进行处理[2],获得各基因座的等位基因频率、杂合度观察值(HO)、个人识别率(DP)、非父排除率(PE)、偶合概率(Pm)和多态性信息总量(PIC)等群体遗传学参数;按文献[3-4]方法计算杂合度期望值(He)、累计个人识别能力和累计非父排除率。
2 结果
292名无关个体的15个STR基因座的等位基因频率见表1。按文献[5]的方法,将低频率的等位基因并组统计,经χ2检验,所有基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05,无显著性差异)。15个基因座共检出157个等位基因,频率分布在0.001 7~0.558 2之间;基因型共465种,频率分布在0.003 4~0.298 0之间。292名无关个体的15个STR基因座的遗传学参数见表2。

表1 马鞍山地区汉族人群15个STR基因座的等位基因及频率
3 讨论
此次调查15个STR基因座,发现有6个基因座检出14个等位基因阶梯以外的等位基因,分别是D21S11 的30.3、31.1,D7S820 的 9.1、9.2,D3S1358的11、20,D13S317 的 7,D19S433 的 18.2,FGA 的16.2、20.2、22.2、23.2、24.2、25.2,以 FGA 为多,有6个。可能与本文调查的群体差异、地域差异有关。……
