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真核生物启动子研究概述

2014-06-13李圣彦郎志宏黄大昉

生物技术进展 2014年3期
关键词:研究

李圣彦, 郎志宏, 黄大昉

中国农业科学院生物技术研究所,农业部农业基因组学重点实验室(北京),北京100081

启动子是指RNA聚合酶识别、结合和启始转录的一段DNA序列,通常位于基因上游。启动子是调控基因表达的“指挥棒”,它能够控制基因表达的水平、部位及方式。深入研究启动子功能对于了解生物的生长发育、防御系统、疾病等都有非常重要的意义。本文总结一些研究启动子的方法及研究进展,以期能够为启动子的研究提供参考。

1 启动子的克隆

1.1 启动子捕获(promoter trap)技术

启动子捕获技术是一种克隆启动子的方法。该方法最早应用于大肠杆菌[1],后广泛应用于果蝇[2]、小鼠[3]和植物[4]等真核生物中。启动子捕获载体通常是一个包含报告基因的载体,在报告基因上游插入不同基因序列,如果可以驱动报告基因表达,则可判断插入片段具有启动子活性,进而从报告基因上游序列中分离出启动子序列(图1)[5]。

图1 启动子捕获载体示意图[6]Fig.1 A promoter trap vector diagram[6].

启动子捕获载体必须要正确的插入到外显子中才能表达,然而启动子捕获载体插入到外显子的频率非常的低[3,7],比增强子捕获载体的插入频率至少低200倍。因此启动子捕获载体通常含有筛选标记基因,如新霉素抗性基因(neo)或β-半乳糖苷酶-NeoR融合报告基因(图1),增加筛选的准确性。启动子捕获技术能够产生大量的突变,从中可以筛选出大量的启动子序列。但是这种插入位点的选择有一定的偏好性,因此该方法不能够在全基因组范围内产生近乎饱和的突变。……

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