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16个线粒体DNA SNP复合检测体系的建立

2014-05-21聂燕钗周怀谷

法医学杂志 2014年1期
关键词:体系检测

吴 丹 ,聂燕钗 ,曹 禹 ,曹 渊 ,周怀谷

(1.上海市公安局物证鉴定中心 法医物证学现场应用技术公安部重点实验室 上海市现场物证重点实验室,上海 200083;2.复旦大学上海医学院,上海 200032;3.无锡中德美联生物技术有限公司,江苏 无锡 214174)

人类线粒体DNA(mtDNA)是位于细胞核以外的唯一基因组DNA,具有突变率高、遵循母系遗传的特点,与每个体细胞核DNA只有两个拷贝相比,其mtDNA则有成百上千个拷贝,因此,对那些因微量、降解、腐败等原因而造成核DNA分型失败的生物检材进行mtDNA检测分析成为法医物证领域又一重要的技术手段[1]。同时,在母系亲缘关系认定、大型灾难调查、考古研究等方面,mtDNA检测分析也显示出良好的应用前景。目前常规的mtDNA检测方法仍然是对其高变区的直接测序,存在步骤繁琐、费时费力、测序区段有限等缺陷,大大影响了mtDNA在法医物证领域的研究和应用。

本研究利用单核苷酸多态性(SNP)遗传标记分布广泛、遗传稳定、分析片段短、可实现高通量、自动化检测等特点[2],结合等位基因特异性引物扩增和毛细管电泳检测,开发建立一种16个mtDNA SNP的复合检测体系,对mtDNA进行简便、有效的高通量分型提供一种新的技术手段。

1 材料与方法

1.1 材料

50份汉族无关个体FTA卡血液样本,通风干燥处保存。

1.2 主要仪器与试剂

QIAcube多功能全自动样本制备工作站(德国QIAGEN公司),9700型PCR扩增仪(美国AB公司),7500实时荧光PCR仪(美国AB公司),3130XL遗传分析仪(美国AB公司),Quantifiler DNA定量试剂盒(美国 AB 公司),Wizard®DNA Clean-up System(美国 Promega公司),BigDye Terminator Cycle Sequencing试剂盒(美国AB公司)。

1.3 提取DNA与定量分析

应用QIAcube多功能全自动样本制备工作站提取FTA卡血样DNA,详见使用说明。……

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