葛菲菲，刘 健，杨德全，鞠厚斌，葛 杰，周锦萍

（上海市动物疫病预防控制中心，上海 201103）

上海市三株H9N2鸭禽流感病毒全基因遗传进化分析

葛菲菲，刘 健，杨德全，鞠厚斌，葛 杰，周锦萍

（上海市动物疫病预防控制中心，上海 201103）

为了解上海市鸭群中H9N2亚型禽流感病毒（Avian influenza virus，AIV）的遗传变异特征，以及与疫苗株A/Chicken/Shan dong/6/1996和A/Chicken/Shanghai/F/1998之间的遗传距离，对2007年和2009年分离自上海市鸭气管和泄殖腔样品采用荧光RT-PCR检测，将H9亚型禽流感病毒核酸阳性样品处理后，经鸡胚尿囊腔接种分离病毒，HI进一步确定血凝素( haemagglutin,HA）亚型，随后进行了全基因测序，并结合GenBank中的相关序列进行遗传进化分析。结果表明：3株分离毒株为H9N2亚型鸭禽流感病毒，HA蛋白裂解位点的氨基酸组成为PARSSRGLF，符合低致病性禽流感病毒特征，均属于经典的H9N2 Ck/Bei群系；NA基因均属于Y280系；NP、PA基因和A/Goose/Guangdong/1/1996（H5亚型）归为一群；PB2和M基因属于Qa/HK/G1/97系；NS基因仍为Ck/Bei系；2007年的分离株和2009年的分离株在PB1基因上分属不同亚群。3株病毒的HA1基因与疫苗株A/Chicken/Shandong/6/1996和A/Chicken/Shanghai/F/1998 之间的遗传距离均大于7%。由此可见，3株鸭H9N2亚型毒株可能是由不同禽流感病毒基因亚群间发生自然重排的产物，现有疫苗对分离株的保护性需要进一步评估。

H9N2亚型禽流感病毒；遗传进化分析；遗传距离

禽流感（avian influenza，AI）是一种由A型禽流感病毒（Avian influenza virus，AIV）引起的禽类烈性传染病，其病原属于正黏病毒科、流感病毒属。H9N2亚型AIV为低致病性禽流感病毒，不仅在全世界范围的禽类中广泛流行，而且可以感染人。在鸭群中H9亚型AIV很少引起发病，但水禽尤其鸭是流感病毒的贮存库，对AIV的发生及传播起到了非常重要的作用。……