红罗非鱼MyoD基因克隆及序列分析
2014-03-21郭奕惠范嗣刚黄桂菊朱克诚喻达辉
郭奕惠 范嗣刚 黄桂菊 朱克诚 喻达辉
(中国水产科学研究院南海水产研究所 农业部南海渔业资源开发利用重点实验室, 广州 510300)
红罗非鱼MyoD基因克隆及序列分析
郭奕惠 范嗣刚 黄桂菊 朱克诚 喻达辉
(中国水产科学研究院南海水产研究所 农业部南海渔业资源开发利用重点实验室, 广州 510300)
MyoD基因是MRFs家族中的一员,能调控肌肉细胞活性和增殖,在肌肉形成过程中起正调控作用。采用同源基因克隆和RACE方法获得红罗非鱼MyoD基因的cDNA序列。开放阅读框长903 bp,编码300个氨基酸,其中第1-114个氨基酸为碱性结构(Basic domain),第109-165个氨基酸为螺旋-环-螺旋结构(Helix-Loop-Helix domain),第199-213个氨基酸为周期蛋白依赖性蛋白激酶4(CDK4)结合区域,第233-249为Helix III结构,无信号肽序列。MyoD蛋白的二级结构为螺旋-环-螺旋二聚体。基于MyoD构建的鱼类系统进化树显示红罗非鱼,尼罗罗非鱼和奥利亚罗非鱼聚为一支。
MyoD 序列分析 克隆 罗非鱼
红罗非鱼(Oreochromis sp.)体呈粉红色,是莫桑比克罗非鱼(O. mossambicus)×尼罗罗非鱼(O. niloticus)杂交产生的后代。红罗非鱼生长速度快,产量高、肉味鲜美,经济效益好,在两广地区可常年养殖,深受养殖户和消费者喜爱。
大多数鱼类可食性部分主要是肌肉。提高肌肉生长速度能短时间内增加鱼的产量,从而增加收益。在分子水平上,鱼类肌肉生长受生肌调节因子MRFs家族(Myogenic regulatory factors,MRFs)调控。MRFs家族基因均具有保守的碱性螺旋-环-螺旋结构域(Basic helix-loop-helix,bHLH),该结构域能与E12和E47等蛋白结合形成二聚体复合物,进而与E-box(CANNTG)结合,从而激活肌肉特异性转录本[1-3]。
MyoD基因(Myogenic differentiation antigen),是MRFs家族中的一员,能调控肌肉细胞活性和增殖,在肌肉形成过程中起正调控作用,缺失后导致成肌细胞无法进行增殖和分化。……
