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甘蔗类异黄酮还原酶(IRL)基因的克隆与表达分析

2014-03-21谢晓娜张小秋邵敏朱惠杨丽涛2李杨瑞

生物技术通报 2014年11期
关键词:植物分析

谢晓娜张小秋邵敏朱惠杨丽涛,2李杨瑞,2

(1..广西大学农学院 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁 530004;2.中国农业科学院甘蔗研究中心 广西农业科院农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室 广西甘蔗遗传改良重点实验室,南宁 530007)

甘蔗类异黄酮还原酶(IRL)基因的克隆与表达分析

谢晓娜1张小秋1邵敏1朱惠1杨丽涛1,2李杨瑞1,2

(1..广西大学农学院 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁 530004;2.中国农业科学院甘蔗研究中心 广西农业科院农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室 广西甘蔗遗传改良重点实验室,南宁 530007)

采用 RT-PCR 技术从甘蔗中克隆 SoIRL基因,用生物信息学方法对获得的氨基酸序列进行分析,利用荧光定量PCR 技术研究SoIRL基因在甘蔗不同组织和不同胁迫条件下的表达特性。结果表明,克隆获得甘蔗 SoIRL,GenBank 登录号为KF808324。该 cDNA 全长 1 169 bp,含有 1 个 927 bp 的完整开放阅读框(ORF),编码 309个氨基酸。系统进化树分析显示,甘蔗SoIRL 与玉米的 IRL 蛋白亲缘关系较近。qRT-PCR 分析表明 SoIRL 在甘蔗根、茎、叶中均有表达;在RSD病菌及低温(4℃)、聚乙二醇(PEG)、NaCl 和 脱落酸(ABA)4种非生物胁迫下均被诱导表达,但表达模式不同。说明该基因可能参与甘蔗应答RSD过程,并可能在非生物胁迫中也发挥了作用。

甘蔗 类异黄酮还原酶 基因克隆 表达分析

甘蔗是制糖的主要原料,是我国最重要的糖料作物,也是极具潜力的生物质能源作物[1],甘蔗宿根矮化病(Ratoon stuning disease,RSD)是甘蔗生产中最为严重的细菌病害之一,常导致感病品种新

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